CHEMOPREVCHEMOPREV

Indonesian Journal of Cancer ChemopreventionIndonesian Journal of Cancer Chemoprevention

Kanker serviks adalah salah satu kanker yang paling umum terjadi pada wanita di seluruh dunia dan di Indonesia. B-cell lymphoma 2 (Bcl-2) dapat berperan dalam menyebabkan kanker dengan menghambat apoptosis. Tujuan penelitian ini adalah untuk menganalisis senyawa kimia dari tanaman sengkubak (Pycnarrhena cauliflora Diels.), yang dapat bertindak sebagai penghambat antiapoptosis dengan mengikat reseptor B-cell lymphoma 2 (Bcl-2). Penelitian ini dilakukan secara in silico dengan metode docking molekul dan simulasi dinamika molekul. Docking molekul menggunakan perangkat lunak AutoDock 4.2.6 dan visualisasi menggunakan Biovia Discovery Studio. Simulasi dinamika molekul menggunakan perangkat lunak Gromacs 5.1.2 dan visualisasi hasil menggunakan Grace. Longipinocarvone adalah ligan uji terbaik dengan nilai ΔGbind terkecil yaitu -6,99 kkal/mol dibandingkan dengan kontrol positif doxorubisin dan senyawa lainnya, yang menunjukkan afinitas Longipinocarvone untuk mengikat reseptor Bcl-2 lebih baik daripada doxorubisin.

Hasil docking molekul menunjukkan bahwa Longipinocarvone memiliki nilai ΔGbind terkecil yaitu -6,99 kkal/mol, yang menunjukkan afinitasnya yang lebih tinggi dibandingkan dengan doxorubisin dan senyawa uji lainnya.Longipinocarvone dan doxorubisin memiliki interaksi yang sama dengan lima residu asam amino, yaitu PHE71, ALA108, LEU96, MET74, dan PHE63 melalui interaksi hidrofobik.Analisis parameter RMSD, RMSF, dan Radius of Gyration (Rg) pada simulasi dinamika molekul menunjukkan bahwa kompleks protein-Longipinocarvone dan protein-doxorubisin memiliki stabilitas yang baik dalam mengikat Bcl-2, dengan nilai RMSD dan RMSF yang memenuhi kriteria, yaitu <3 Å (0,3 nm).Rg menunjukkan bahwa kedua kompleks stabil selama simulasi dan memiliki pergerakan ligan-protein yang serupa satu sama lain.

Berdasarkan hasil penelitian ini, saran penelitian lanjutan yang dapat dilakukan adalah: (1) Mengembangkan senyawa Longipinocarvone sebagai kandidat obat kanker serviks dengan melakukan studi in vitro dan in vivo untuk mengkonfirmasi aktivitas anti-kanker dan mekanisme kerja spesifiknya. (2) Melakukan studi lebih lanjut untuk mengidentifikasi senyawa aktif lain dari tanaman sengkubak (Pycnarrhena cauliflora Diels.) yang memiliki potensi sebagai obat kanker serviks. (3) Menganalisis lebih lanjut interaksi antara senyawa aktif dengan reseptor Bcl-2 menggunakan teknik spektroskopi dan metode eksperimental lainnya untuk memahami mekanisme interaksi secara lebih mendalam.

Read online
File size2.07 MB
Pages13
DMCAReport

Related /

ads-block-test