UNIVERSITAS BTHUNIVERSITAS BTH

Jurnal Kesehatan Bakti Tunas Husada: Jurnal Ilmu-ilmu Keperawatan, Analis Kesehatan dan FarmasiJurnal Kesehatan Bakti Tunas Husada: Jurnal Ilmu-ilmu Keperawatan, Analis Kesehatan dan Farmasi

Hipertiroidisme merupakan gangguan endokrin yang dipengaruhi oleh faktor genetik, imunologis, dan regulasi ekspresi gen. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis variasi genetik serta pola ekspresi gen spesifik jaringan pada hipertiroidisme menggunakan pendekatan bioinformatika integratif. Penelitian dilakukan secara in-silico menggunakan basis data GWAS Catalog, GTEx Portal, Ensembl Genome Browser, SNPnexus, dan HaploReg v4.2. Identifikasi SNP dilakukan menggunakan kata kunci “Hyperthyroidism dengan nilai signifikansi genom luas (p < 1×10⁻⁸) dan difokuskan pada varian missense. Analisis dilanjutkan dengan evaluasi ekspresi gen, anotasi genom, prediksi dampak fungsional protein, serta distribusi alel populasi. Hasil penelitian menunjukkan terdapat 506 SNP terkait hipertiroidisme dan 17 missense variant yang berpotensi memengaruhi fungsi protein. Gen yang paling banyak berkaitan dengan regulasi imun dan autoimun tiroid meliputi PTPN22, HLA-DPB1, TAP2, FCRL3, ADCY7, dan TG. Analisis fungsional menunjukkan SNP rs78534766 pada gen ADCY7 termasuk kategori probably damaging. Selain itu, ditemukan perbedaan distribusi alel antar populasi yang menunjukkan adanya variasi kerentanan genetik terhadap hipertiroidisme. Pendekatan bioinformatika integratif mampu memberikan gambaran molekuler yang lebih komprehensif dan berpotensi mendukung pengembangan precision medicine berbasis genomik pada hipertiroidisme.

Hipertiroidisme memiliki keterkaitan erat dengan variasi genetik yang berhubungan dengan regulasi sistem imun dan mekanisme autoimun.Analisis bioinformatika integratif berhasil mengidentifikasi beberapa gen penting, seperti PTPN22, HLA-DPB1, TAP2, FCRL3, ADCY7, dan TG, yang berpotensi berperan dalam patogenesis hipertiroidisme.Sebanyak 17 missense variant berhasil diseleksi dari 506 SNP terkait hipertiroidisme.Analisis fungsional menunjukkan bahwa SNP rs78534766 pada gen ADCY7 termasuk kategori probably damaging dan berpotensi memengaruhi fungsi protein.Selain itu, pola ekspresi gen dan distribusi alel yang berbeda antar populasi menunjukkan bahwa mekanisme hipertiroidisme dipengaruhi oleh interaksi kompleks antara faktor genetik, jaringan spesifik, dan karakteristik populasi.Pendekatan bioinformatika integratif pada penelitian ini mampu memberikan gambaran molekuler yang lebih komprehensif terkait hipertiroidisme serta berpotensi mendukung pengembangan precision medicine berbasis genomik.

Penelitian lanjutan perlu dilakukan untuk memvalidasi SNP potensial, khususnya pada gen ADCY7, melalui pendekatan eksperimental dan analisis multi-omics agar mekanisme biologis hipertiroidisme dapat dipahami lebih mendalam. Selain itu, kajian tentang pengaruh varians genetik pada respons imun dan regulasi inflamasi dapat dikembangkan untuk mengidentifikasi target terapi baru. Terakhir, studi integrasi data genomik dengan profil ekspresi gen spesifik jaringan di berbagai populasi dapat meningkatkan pemahaman tentang variabilitas kerentanan genetik terhadap hipertiroidisme.

  1.  . 0 doi.org/10.3390/ijms221810090A 0 doi 10 3390 ijms221810090
  2. Yudhani, Pakha, Suyatmi, and Irham: Identifying pathogenic variants related to systemic lupus erythematosus... genominfo.org/journal/view.php?doi=10.5808/gi.23002Yudhani Pakha Suyatmi and Irham Identifying pathogenic variants related to systemic lupus erythematosus genominfo journal view php doi 10 5808 gi 23002
  3. The GTEx Consortium atlas of genetic regulatory effects across human tissues | Science. gtex consortium... science.org/doi/10.1126/science.aaz1776The GTEx Consortium atlas of genetic regulatory effects across human tissues Science gtex consortium science doi 10 1126 science aaz1776
  4. Predicting Functional Effect of Human Missense Mutations Using PolyPhen‐2 - Adzhubei - 2013... doi.org/10.1002/0471142905.hg0720s76Predicting Functional Effect of Human Missense Mutations Using PolyPhenyAAAa2 Adzhubei 2013 doi 10 1002 0471142905 hg0720s76
Read online
File size458.9 KB
Pages7
DMCAReport

Related /

ads-block-test