UNSOEDUNSOED
JOS | Universitas Jenderal SoedirmanJOS | Universitas Jenderal SoedirmanSARS-CoV-2 (Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus-2) merupakan virus penyebab pandemi COVID-19 secara global. Virus ini diketahui mengkodekan empat protein struktural dan enam belas protein non‑struktural, termasuk Papain‑Like protease (PLpro). Enzim ini berperan penting dalam maturasi poli‑protein viral, pembentukan replika‑transkriptase, serta penyaluran respons imun innate inang terhadap infeksi virus. Untuk menghambat aktivitas PLpro, sejumlah senyawa inhibitor telah dikembangkan dari sumber alam. Senyawa flavonoid yang berasal dari daun bay (Syzygium polyanthum) dan kulit mahoni (Swietenia macrophylla), serta fenolik dari kulit kayu putih (Gmelina arborea Roxb.), telah dilaporkan memiliki aktivitas antivirus, namun belum ada studi mengenai potensi mereka sebagai inhibitor PLpro SARS‑CoV‑2. Oleh karena itu, penelitian ini bertujuan menyelidiki efek penghambatan PLpro SARS‑CoV‑2 oleh 11 ligan daun bay, 3 ligan kulit mahoni, dan 6 ligan kulit kayu putih menggunakan metode in silico dengan YASARA dan PLANTS. Ligand terbaik yang diperoleh adalah epigallocatechin‑3‑gallate (−98,93 kcal/mol), katekin (−80,10 kcal/mol), epikatekin (−80,12 kcal/mol), dan balanophonin (−83,36 kcal/mol) berdasarkan nilai energi ikatan yang lebih rendah dibandingkan ligan referensi ribavirin (−74,06 kcal/mol) dan benserazide (−90,93 kcal/mol). Selain itu, keempat ligan tersebut memenuhi prediksi sifat fisikokimia, farmakokinetik, dan toksisitas, berbeda dengan ligan alami VIR251 yang berisiko menginhibisi hERG sehingga berpotensi menyebabkan konsekuensi fatal. Berdasarkan hasil tersebut, senyawa-senyawa tersebut dapat dikembangkan sebagai obat alternatif yang efektif dalam menghambat PLpro SARS‑CoV‑2.
Empat ligan uji, yaitu epigallocatechin‑3‑gallate (−98,93 kcal/mol) dari daun S. polyanthum, katekin (−80,10 kcal/mol) dan epikatekin (−80,12 kcal/mol) dari kulit S. macrophylla, serta balanophonin (−83,36 kcal/mol) dari kulit G. arborea, menunjukkan energi ikatan paling rendah dibandingkan ligan referensi ribavirin (−74,06 kcal/mol) dan benserazide (−90,93 kcal/mol).Keempat ligan tersebut memenuhi kriteria farmakokinetik, sifat fisikokimia, dan toksisitas, sedangkan ligan alami VIR251 memiliki probabilitas 75 % menghambat hERG.Dengan profil obat yang menjanjikan, senyawa‑senyawa ini berpotensi sebagai agen antivirus alternatif terhadap SARS‑CoV‑2.
Penelitian selanjutnya sebaiknya memvalidasi aktivitas antiviral in vitro dari empat ligan terpilih (epigallocatechin‑3‑gallate, katekin, epikatekin, dan balanophonin) terhadap papain‑like protease SARS‑CoV‑2, sehingga dapat memastikan keakuratan prediksi docking yang dilakukan secara in silico. Selain itu, dilakukan modifikasi struktural pada keempat senyawa tersebut dengan tujuan meningkatkan penyerapan gastrointestinal (GI) tanpa mengurangi nilai energi ikatan, misalnya dengan penggantian gugus hidroksil atau esterifikasi selektif yang dapat memperbaiki sifat lipofilikanya. Selanjutnya, dilakukan uji toksisitas akut dan kronis serta profil farmakokinetik pada model hewan untuk menilai keamanan, distribusi, metabolisme, dan eliminasi senyawa, serta mengidentifikasi potensi interaksi dengan saluran hERG yang sebelumnya terdeteksi pada ligan VIR251. Akhirnya, penelitian dapat mengevaluasi efek sinergi antara ligan‑ligan ini dan obat antivirus yang sudah ada, seperti remdesivir atau ritonavir, untuk menentukan apakah kombinasi terapi dapat meningkatkan efikasi antiviral serta mengurangi dosis yang diperlukan. Dengan pendekatan multidisipliner ini, diharapkan dapat dihasilkan kandidat obat yang lebih aman, bioavailable, dan efektif dalam melawan infeksi COVID‑19.
| File size | 539.59 KB |
| Pages | 13 |
| DMCA | Report |
Related /
UNIDAUNIDA Hasil peramalan menunjukkan penurunan terus-menerus dalam produktivitas, dengan nilai yang menurun dari 1 ton per hektar pada tahun 2024 menjadi 0,6266Hasil peramalan menunjukkan penurunan terus-menerus dalam produktivitas, dengan nilai yang menurun dari 1 ton per hektar pada tahun 2024 menjadi 0,6266
UNSOEDUNSOED Karakteristik karbon aktif dan elektroda superkapasitor dianalisis dengan BET, SEM, CV, dan GCD. Bahan yang dihasilkan menunjukkan struktur mikropori yangKarakteristik karbon aktif dan elektroda superkapasitor dianalisis dengan BET, SEM, CV, dan GCD. Bahan yang dihasilkan menunjukkan struktur mikropori yang
UNSOEDUNSOED Penelitian ini memusatkan upaya pada isolasi urease dari biji lentil merah, diikuti dengan proses immobilisasi. Tujuan penelitian adalah mengoptimalkanPenelitian ini memusatkan upaya pada isolasi urease dari biji lentil merah, diikuti dengan proses immobilisasi. Tujuan penelitian adalah mengoptimalkan
UNSOEDUNSOED , Ocimum basilicum L. , Leucas lavandulifolia Sm. , dan Perilla frutescens (L. ) Britton. Ekstrak dari keempat spesies Lamiaceae dievaluasi untuk kapasitas, Ocimum basilicum L. , Leucas lavandulifolia Sm. , dan Perilla frutescens (L. ) Britton. Ekstrak dari keempat spesies Lamiaceae dievaluasi untuk kapasitas
UNSOEDUNSOED Penelitian ini bertujuan untuk mengformulasikan tabir surya alami dengan menggabungkan gel lidah buaya dengan ekstrak kulit bawang putih dan bawang BombayPenelitian ini bertujuan untuk mengformulasikan tabir surya alami dengan menggabungkan gel lidah buaya dengan ekstrak kulit bawang putih dan bawang Bombay
UNSOEDUNSOED Tes aktivitas antibakteri dilakukan menggunakan metode difusi agar, dan Konsentrasi Hambat Minimum (MIC) ditentukan menggunakan metode mikroplat. HasilTes aktivitas antibakteri dilakukan menggunakan metode difusi agar, dan Konsentrasi Hambat Minimum (MIC) ditentukan menggunakan metode mikroplat. Hasil
UNSOEDUNSOED Sifat fisikokimia, termasuk ketebalan, warna, kekuatan tarik, elongasi, kadar air, kekeruhan, kelarutan dalam air, laju transmisi uap air, biodegradabilitas,Sifat fisikokimia, termasuk ketebalan, warna, kekuatan tarik, elongasi, kadar air, kekeruhan, kelarutan dalam air, laju transmisi uap air, biodegradabilitas,
UNSOEDUNSOED Beberapa metode analitik telah dikembangkan untuk menentukan konsentrasi capsaicin, namun memiliki banyak kelemahan seperti mahal, waktu analisis lama,Beberapa metode analitik telah dikembangkan untuk menentukan konsentrasi capsaicin, namun memiliki banyak kelemahan seperti mahal, waktu analisis lama,
Useful /
UNNESUNNES Dengan pendekatan kualitatif, pengumpulan data dilakukan melalui observasi, wawancara, dan dokumentasi selama proses pembelajaran. Hasil penelitian menunjukkanDengan pendekatan kualitatif, pengumpulan data dilakukan melalui observasi, wawancara, dan dokumentasi selama proses pembelajaran. Hasil penelitian menunjukkan
UNIDAUNIDA Banyak studi ilmiah menyatakan bahwa susu hewani tidak dapat digantikan oleh PBMA dari segi nutrisi. Namun, tidak semua konsumen menyadari hal ini. OlehBanyak studi ilmiah menyatakan bahwa susu hewani tidak dapat digantikan oleh PBMA dari segi nutrisi. Namun, tidak semua konsumen menyadari hal ini. Oleh
UNIDAUNIDA 5%, and 10% for avocado coffee milk, and 5%, 10%, and 15% for durian coffee milk. The hedonic rating test revealed that formulations containing 5% avocado5%, and 10% for avocado coffee milk, and 5%, 10%, and 15% for durian coffee milk. The hedonic rating test revealed that formulations containing 5% avocado
ILOMATAILOMATA Secara umum, mahasiswa memiliki keleluasaan lebih besar dalam mengelola keuangan pribadi. Namun, fenomena saat ini tidak menunjukkan bahwa mahasiswa memilikiSecara umum, mahasiswa memiliki keleluasaan lebih besar dalam mengelola keuangan pribadi. Namun, fenomena saat ini tidak menunjukkan bahwa mahasiswa memiliki