Publisher

INABJINABJ

Journal The Indonesian Biomedical JournalThe Indonesian Biomedical Journal Abstract

β-thalassemia memiliki tingkat keparahan penyakit yang heterogen, mulai dari ringan hingga mayor. Long noncoding RNA (lncRNA) diketahui mengatur microRNA (miRNA) dan gen, sehingga berpotensi memodifikasi fenotipe penyakit. Namun, data tentang lncRNA pada β-thalassemia masih terbatas, dan belum ada penelitian yang meneliti kesenjangan ini di Malaysia. Oleh karena itu, penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi profil ekspresi lncRNA pada β-thalassemia mayor dan trait pada populasi Malaysia. Studi kasus-kontrol dilakukan dalam dua fase di Rumah Sakit Anak dan Wanita Tunku Azizah dan Institut Penelitian Medis, dari September 2019 hingga November 2021. Sebanyak 141 individu direkrut, terdiri dari β-thalassemia mayor (MAJOR, n=11), β-thalassemia trait (TRAIT, n=17), dan kontrol sehat (CON, n=113). Semua peserta diperiksa genotipnya untuk thalassemia dan dinilai untuk hemoglobin dan indeks sel darah merah (RBC). Pada fase pertama, penemuan lncRNA dilakukan menggunakan microarray, dan ekspresi diferensial lncRNA (DEL) pada kelompok MAJOR, TRAIT, dan CON diidentifikasi. LncRNA yang signifikan dikenakan prediksi lncRNA-miRNA, dan ontologi gen dan jalur biologis dianalisis. Pada fase validasi, enam lncRNA potensial divalidasi lebih lanjut menggunakan lncRNA polymerase chain reaction (PCR) custom array. Sebanyak 364 DEL diidentifikasi pada kelompok MAJOR, dan 128 DEL diidentifikasi pada kelompok TRAIT. Antara kelompok MAJOR dan TRAIT, 100 DEL mengalami disregulasi pada kelompok MAJOR. Dua jaringan molekuler yang terdiri dari interaksi lncRNA dengan miRNA diidentifikasi dan dikaitkan dengan trait dan fenotipe mayor, menghasilkan enam lncRNA potensial untuk validasi. Di antara enam lncRNA ini, tiga lncRNA (TYMSOS, VASH1-AS1, dan LINC01001) berkurang pada kelompok MAJOR (fold change (FC)=-6,67, p=0,026; FC=-8,33, p=0,022; dan FC=-8,33, p=0,021, berturut-turut). Ekspresi lncRNA TYMSOS, VASH1-AS1, dan LINC01001 berbeda antara pasien β-thalassemia mayor dan trait. Oleh karena itu, lncRNA ini dapat berfungsi sebagai biomarker baru untuk tingkat keparahan penyakit β-thalassemia pada populasi Malaysia.

Conclusion

Ekspresi lncRNA TYMSOS, VASH1-AS1, dan LINC01001 berbeda antara pasien β-thalassemia mayor dan trait.Oleh karena itu, lncRNA ini berpotensi menjadi biomarker baru untuk tingkat keparahan penyakit β-thalassemia pada populasi Malaysia.Penelitian lebih lanjut diperlukan untuk mengkonfirmasi signifikansi lncRNA ini dan mengeksplorasi interaksi molekuler mereka dalam menentukan tingkat keparahan penyakit.

Future Research

Berdasarkan penelitian ini, beberapa saran penelitian lanjutan dapat diajukan. Pertama, penting untuk melakukan studi validasi dengan ukuran sampel yang lebih besar dan kelompok kontrol yang lebih beragam untuk mengkonfirmasi temuan bahwa lncRNA TYMSOS, VASH1-AS1, dan LINC01001 dapat menjadi biomarker yang akurat untuk tingkat keparahan β-thalassemia. Kedua, penelitian lebih lanjut diperlukan untuk menyelidiki mekanisme molekuler yang mendasari peran lncRNA ini dalam regulasi ekspresi gen dan respons terhadap stres oksidatif pada pasien β-thalassemia. Hal ini dapat melibatkan studi in vitro menggunakan sel eritroid yang dimodifikasi secara genetik untuk memanipulasi ekspresi lncRNA dan menilai dampaknya pada fenotipe seluler. Ketiga, penelitian prospektif yang mengikuti pasien β-thalassemia dari waktu ke waktu dapat membantu menentukan apakah perubahan ekspresi lncRNA dapat memprediksi perkembangan penyakit dan respons terhadap pengobatan. Studi ini juga dapat mengeksplorasi interaksi antara lncRNA, miRNA, dan faktor genetik lainnya dalam memodulasi tingkat keparahan β-thalassemia.

References

1. Long Noncoding RNAs TYMSOS, VASH1-AS1, and LINC01001 Expressions as Biomarkers of β-thalassaemia... doi.org/10.18585/inabj.v17i5.3766Long Noncoding RNAs TYMSOS VASH1 AS1 and LINC01001 Expressions as Biomarkers of thalassaemia doi 10 18585 inabj v17i5 3766
2. Observational study on the current status of thalassaemia in Malaysia: a report from the Malaysian Thalassaemia... doi.org/10.1136/bmjopen-2020-037974Observational study on the current status of thalassaemia in Malaysia a report from the Malaysian Thalassaemia doi 10 1136 bmjopen 2020 037974
3. Abnormal regulation of microRNAs and related genes in pediatric β‐thalassemia -... doi.org/10.1002/jcla.23945Abnormal regulation of microRNAs and related genes in pediatric yaAyAAAathalassemia doi 10 1002 jcla 23945

Metadata

File size	1.72 MB
Pages	11
DMCA	Report