UNIBUNIB
Jurnal EngganoJurnal EngganoKarang lunak merupakan salah satu penyusun komunitas karang yang berguna bagi ekosistem terumbu karang. Keberadaannya di ekosistem terumbu karang sangat penting bagi proses rantai makanan di lautan. Sulitnya identifikasi morfologi karang ini disebabkan variasi sklerit yang beragam. Oleh karena itu penting adanya identifikasi molekuler sebagai penunjang data taksonomi karang ini. Akan tetapi, dalam proses identifikasi molekuler karang ini masih banyak hambatan yang terjadi dalam proses ekstraksi maupun PCR nya. Hal ini dimungkinkan karena adanya kalsium karbonat yang tersusun di seluruh tubuh karang ini. Oleh karena itu, penelitian ini dilakukan untuk mendapatkan proses ekstraksi DNA dan PCR yang optimal dalam proses identifikasi secara molekuler. Proses ekstraksi dilakukan dengan menggunakan Kit Ekstraksi dan PCR dengan menggunakan KIT PCR. Hasil ekstraksi menunjukan bahwa Xenia sp memiliki konsentrasi DNA yang tertinggi dengan nilai 53.90 (ng/ul) dan terendah pada jenis Sarcophyton trocheliophorum sebesar 26.70 (ng/ul). Optimalisasi PCR menghasilkan hasil yang baik pada spesies Xenia sp., dan Lobophytum pauciflorum sedangkan pada sampel jenis Sarcophyton trocheliophorum pita DNA menunjukan hasil yang smear.
Hasil ekstraksi setelah di ujikan pada nanodrop spektrofotmeter jenis Xenia sp memiliki konsentrasi DNA yang tertinggi dengan nilai 53.90 (ng/ul) dan terendah pada jenis Sarcophyton trocheliophorum sebesar 26.Tingginya konsentrasi DNA pada karang lunak jenis Xenia sp dimungkinkan karena dari karakter tissue karang ini yang lebih lunak sehingga mudah di ekstraksi sedangkan rendahnya konsentrasi DNA ini dimungkinkan karena adanya kontaminasi pada hasil ekstraksi.Optimalisasi PCR menghasilkan hasil yang baik pada spesies Xenia sp., dan Lobophytum pauciflorum sedangkan pada sampel jenis Sarcophyton trocheliophorum pita DNA menunjukan hasil yang smear.
Penelitian lanjutan dapat fokus pada pengembangan metode ekstraksi DNA alternatif untuk spesies karang lunak seperti Sarcophyton trocheliophorum yang memiliki hasil ekstraksi rendah dan kontaminasi tinggi. Selain itu, perlu dilakukan studi lebih lanjut tentang optimasi suhu annealing PCR untuk spesies yang menunjukkan hasil smear, seperti Sarcophyton trocheliophorum, agar diperoleh amplifikasi DNA yang lebih jelas dan akurat. Terakhir, penelitian juga dapat mengkaji pengaruh kondisi penyimpanan sampel karang lunak (misalnya suhu dan waktu penyimpanan) terhadap kualitas DNA yang dihasilkan, karena hal ini mungkin memengaruhi hasil ekstraksi dan PCR. Dengan menggabungkan pendekatan ini, diharapkan dapat meningkatkan efisiensi identifikasi molekuler karang lunak secara keseluruhan.
| File size | 603.04 KB |
| Pages | 8 |
| DMCA | Report |
Related /
UMADAUMADA Hasil penelitian menunjukkan jenis bulu babi yang dikoleksi diperairan Pulau Sabang, Kabupaten Tolitoli yaitu Tripneustes gratilla, Mespilia globulus,Hasil penelitian menunjukkan jenis bulu babi yang dikoleksi diperairan Pulau Sabang, Kabupaten Tolitoli yaitu Tripneustes gratilla, Mespilia globulus,
EJURNALILMIAHEJURNALILMIAH Program Kreativitas Mahasiswa (PKM) untuk mengembangkan inovasi olahan gurita khas Bengkulu yang memiliki cita rasa unik, bernilai gizi tinggi, dan berdayaProgram Kreativitas Mahasiswa (PKM) untuk mengembangkan inovasi olahan gurita khas Bengkulu yang memiliki cita rasa unik, bernilai gizi tinggi, dan berdaya
JURNALPERIKANANKAMASANJURNALPERIKANANKAMASAN Penelitian ini menunjukkan pentingnya manajemen kualitas air yang berkelanjutan untuk mendukung produktivitas budidaya udang vannamei secara optimal. BerdasarkanPenelitian ini menunjukkan pentingnya manajemen kualitas air yang berkelanjutan untuk mendukung produktivitas budidaya udang vannamei secara optimal. Berdasarkan
APPISIAPPISI Pemanfaatan ekosistem mangrove dalam konsep ekowisata ini sesuai dengan perubahan minat wisatawan, dari old tourism yang hanya berfokus pada rekreasi tanpaPemanfaatan ekosistem mangrove dalam konsep ekowisata ini sesuai dengan perubahan minat wisatawan, dari old tourism yang hanya berfokus pada rekreasi tanpa
UNSULBARUNSULBAR Media ini ditambatkan pada jangkar di kedalaman 8 – 10 m mengikuti topografi terumbu karang tepi. Studi ini mengevaluasi pertumbuhan jenis karang AcroporaMedia ini ditambatkan pada jangkar di kedalaman 8 – 10 m mengikuti topografi terumbu karang tepi. Studi ini mengevaluasi pertumbuhan jenis karang Acropora
UNSULBARUNSULBAR Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui kondisi terumbu karang,. Penelitian ini dilakukan pada tiga stasiun yang terletak pada bagian selatan, barat,Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui kondisi terumbu karang,. Penelitian ini dilakukan pada tiga stasiun yang terletak pada bagian selatan, barat,
UNJUNJ Hasil penelitian menunjukkan bahwa kondisi terumbu karang di Pulau Pari secara umum berada dalam kondisi cukup hingga baik. Penelitian ini menggunakanHasil penelitian menunjukkan bahwa kondisi terumbu karang di Pulau Pari secara umum berada dalam kondisi cukup hingga baik. Penelitian ini menggunakan
UMMUMM Tindak pidana perikanan yang terjadi meliputi praktik penangkapan ikan yang merusak sumber daya ikan dan habitat akuatik seperti pemboman ikan, pembiusanTindak pidana perikanan yang terjadi meliputi praktik penangkapan ikan yang merusak sumber daya ikan dan habitat akuatik seperti pemboman ikan, pembiusan
Useful /
RCSDEVELOPMENTRCSDEVELOPMENT Pelaksanaan pelatihan menyikat gigi terstruktur di TK Kristen Anugerah Jakarta terbukti efektif dalam meningkatkan kebiasaan kebersihan mulut anak pra‑sekolahPelaksanaan pelatihan menyikat gigi terstruktur di TK Kristen Anugerah Jakarta terbukti efektif dalam meningkatkan kebiasaan kebersihan mulut anak pra‑sekolah
APPERTANIAPPERTANI Tiga puluh enam domba induk ekor tipis Jawa dalam kondisi menjelang beranak dipergunakan untuk mempelajari kebutuhan energi dan protein selama delapanTiga puluh enam domba induk ekor tipis Jawa dalam kondisi menjelang beranak dipergunakan untuk mempelajari kebutuhan energi dan protein selama delapan
UIN ANTASARIUIN ANTASARI Penelitian ini mengajukan rekonstruksi tata kelola pertambangan yang mengintegrasikan tujuan hukum Islam untuk menjamin keadilan, perlindungan lingkungan,Penelitian ini mengajukan rekonstruksi tata kelola pertambangan yang mengintegrasikan tujuan hukum Islam untuk menjamin keadilan, perlindungan lingkungan,
IAIN PALANGKARAYAIAIN PALANGKARAYA Primary data was obtained using observation, interview, and documentation techniques, which were then analysed using the theories of the rule of law, al-adahPrimary data was obtained using observation, interview, and documentation techniques, which were then analysed using the theories of the rule of law, al-adah