UNIBUNIB
Jurnal EngganoJurnal EngganoKarang lunak merupakan salah satu penyusun komunitas karang yang berguna bagi ekosistem terumbu karang. Keberadaannya di ekosistem terumbu karang sangat penting bagi proses rantai makanan di lautan. Sulitnya identifikasi morfologi karang ini disebabkan variasi sklerit yang beragam. Oleh karena itu penting adanya identifikasi molekuler sebagai penunjang data taksonomi karang ini. Akan tetapi, dalam proses identifikasi molekuler karang ini masih banyak hambatan yang terjadi dalam proses ekstraksi maupun PCR nya. Hal ini dimungkinkan karena adanya kalsium karbonat yang tersusun di seluruh tubuh karang ini. Oleh karena itu, penelitian ini dilakukan untuk mendapatkan proses ekstraksi DNA dan PCR yang optimal dalam proses identifikasi secara molekuler. Proses ekstraksi dilakukan dengan menggunakan Kit Ekstraksi dan PCR dengan menggunakan KIT PCR. Hasil ekstraksi menunjukan bahwa Xenia sp memiliki konsentrasi DNA yang tertinggi dengan nilai 53.90 (ng/ul) dan terendah pada jenis Sarcophyton trocheliophorum sebesar 26.70 (ng/ul). Optimalisasi PCR menghasilkan hasil yang baik pada spesies Xenia sp., dan Lobophytum pauciflorum sedangkan pada sampel jenis Sarcophyton trocheliophorum pita DNA menunjukan hasil yang smear.
Hasil ekstraksi setelah di ujikan pada nanodrop spektrofotmeter jenis Xenia sp memiliki konsentrasi DNA yang tertinggi dengan nilai 53.90 (ng/ul) dan terendah pada jenis Sarcophyton trocheliophorum sebesar 26.Tingginya konsentrasi DNA pada karang lunak jenis Xenia sp dimungkinkan karena dari karakter tissue karang ini yang lebih lunak sehingga mudah di ekstraksi sedangkan rendahnya konsentrasi DNA ini dimungkinkan karena adanya kontaminasi pada hasil ekstraksi.Optimalisasi PCR menghasilkan hasil yang baik pada spesies Xenia sp., dan Lobophytum pauciflorum sedangkan pada sampel jenis Sarcophyton trocheliophorum pita DNA menunjukan hasil yang smear.
Penelitian lanjutan dapat fokus pada pengembangan metode ekstraksi DNA alternatif untuk spesies karang lunak seperti Sarcophyton trocheliophorum yang memiliki hasil ekstraksi rendah dan kontaminasi tinggi. Selain itu, perlu dilakukan studi lebih lanjut tentang optimasi suhu annealing PCR untuk spesies yang menunjukkan hasil smear, seperti Sarcophyton trocheliophorum, agar diperoleh amplifikasi DNA yang lebih jelas dan akurat. Terakhir, penelitian juga dapat mengkaji pengaruh kondisi penyimpanan sampel karang lunak (misalnya suhu dan waktu penyimpanan) terhadap kualitas DNA yang dihasilkan, karena hal ini mungkin memengaruhi hasil ekstraksi dan PCR. Dengan menggabungkan pendekatan ini, diharapkan dapat meningkatkan efisiensi identifikasi molekuler karang lunak secara keseluruhan.
| File size | 603.04 KB |
| Pages | 8 |
| DMCA | Report |
Related /
STIFARSTIFAR Pengambilan sampel dilakukan dengan metode Concutive Sampling terhadap mahasiswa Fakultas Kedokteran Universitas Islam Sultan Agung Semarang melalui metodePengambilan sampel dilakukan dengan metode Concutive Sampling terhadap mahasiswa Fakultas Kedokteran Universitas Islam Sultan Agung Semarang melalui metode
PUBLIKASI UNTAGCIREBONPUBLIKASI UNTAGCIREBON Luasan kawasan budidaya rumput laut yang masih tersisah di Desa Aimoli masih cukup besar sehingga masyarakat pesisir Desa Aimoli perlu diberikan motivasiLuasan kawasan budidaya rumput laut yang masih tersisah di Desa Aimoli masih cukup besar sehingga masyarakat pesisir Desa Aimoli perlu diberikan motivasi
JURNALPERIKANANKAMASANJURNALPERIKANANKAMASAN Penelitian ini menunjukkan bahwa ekosistem mangrove di kawasan wisata Kairatu Beach terdiri atas delapan jenis mangrove sejati dan empat jenis mangrovePenelitian ini menunjukkan bahwa ekosistem mangrove di kawasan wisata Kairatu Beach terdiri atas delapan jenis mangrove sejati dan empat jenis mangrove
JURNALPERIKANANKAMASANJURNALPERIKANANKAMASAN Penelitian ini menyimpulkan bahwa penangkapan ikan cakalang oleh nelayan Asli Papua di Nabire masih terbatas pada penggunaan alat tangkap sederhana danPenelitian ini menyimpulkan bahwa penangkapan ikan cakalang oleh nelayan Asli Papua di Nabire masih terbatas pada penggunaan alat tangkap sederhana dan
MEDIAPUBLIKASIMEDIAPUBLIKASI Titik lokasi penelitian terdiri atas 6 stasiun pada kedalaman 1-3 m dengan jarak setiap stasiun adalah 100 m. Berdasarkan hasil penelitian dapat disimpulkanTitik lokasi penelitian terdiri atas 6 stasiun pada kedalaman 1-3 m dengan jarak setiap stasiun adalah 100 m. Berdasarkan hasil penelitian dapat disimpulkan
BIOTROPBIOTROP The data obtained were statistically analyzed using the SAS Version 9. 0 program. The analysis carried out was the analysis of variance (ANOVA). DuncansThe data obtained were statistically analyzed using the SAS Version 9. 0 program. The analysis carried out was the analysis of variance (ANOVA). Duncans
UMAUMA Proses ekstraksi metabolit sekunder dari daun bangun-bangun (Coleus amboinicus L. ) dilakukan dengan metode makerasasi dengan metanol, kemudian dipartisiProses ekstraksi metabolit sekunder dari daun bangun-bangun (Coleus amboinicus L. ) dilakukan dengan metode makerasasi dengan metanol, kemudian dipartisi
UMMUMM Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui peran dan hambatan yang dihadapi oleh Penyidik Pegawai Negeri Sipil Perikanan (PPNSP) dalam pencegahan dan penangananPenelitian ini bertujuan untuk mengetahui peran dan hambatan yang dihadapi oleh Penyidik Pegawai Negeri Sipil Perikanan (PPNSP) dalam pencegahan dan penanganan
Useful /
UPN VeteranUPN Veteran 9182–0. 9751, sedangkan konstanta kinetik terkait dengan hukum Arrhenius, k = 0. 034751 e^(–140.23/T). Mekanisme pengendali laju didominasikan9182–0. 9751, sedangkan konstanta kinetik terkait dengan hukum Arrhenius, k = 0. 034751 e^(–140.23/T). Mekanisme pengendali laju didominasikan
STIFARSTIFAR Inhibitor alami herbal α-amylase semakin penting dalam pengobatan diabetes karena efektivitasnya dengan efek samping yang lebih sedikit. Zingiber zerumbetInhibitor alami herbal α-amylase semakin penting dalam pengobatan diabetes karena efektivitasnya dengan efek samping yang lebih sedikit. Zingiber zerumbet
APPERTANIAPPERTANI Penelitian dilakukan untuk mempelajari respon kerbau dari genotipe yang berbeda terhadap perlakuan superovulasi. PMSG sejumlah 2500 IU disuntikkan intraPenelitian dilakukan untuk mempelajari respon kerbau dari genotipe yang berbeda terhadap perlakuan superovulasi. PMSG sejumlah 2500 IU disuntikkan intra
UMMAUMMA Konsentrasi bawang merah 1% merupakan konsentrasi yang optimal untuk persentase setek hidup dan jumlah akar setek daun Sansevieria trifasciata. BerdasarkanKonsentrasi bawang merah 1% merupakan konsentrasi yang optimal untuk persentase setek hidup dan jumlah akar setek daun Sansevieria trifasciata. Berdasarkan