UNIBUNIB
Jurnal EngganoJurnal EngganoKarang lunak merupakan salah satu penyusun komunitas karang yang berguna bagi ekosistem terumbu karang. Keberadaannya di ekosistem terumbu karang sangat penting bagi proses rantai makanan di lautan. Sulitnya identifikasi morfologi karang ini disebabkan variasi sklerit yang beragam. Oleh karena itu penting adanya identifikasi molekuler sebagai penunjang data taksonomi karang ini. Akan tetapi, dalam proses identifikasi molekuler karang ini masih banyak hambatan yang terjadi dalam proses ekstraksi maupun PCR nya. Hal ini dimungkinkan karena adanya kalsium karbonat yang tersusun di seluruh tubuh karang ini. Oleh karena itu, penelitian ini dilakukan untuk mendapatkan proses ekstraksi DNA dan PCR yang optimal dalam proses identifikasi secara molekuler. Proses ekstraksi dilakukan dengan menggunakan Kit Ekstraksi dan PCR dengan menggunakan KIT PCR. Hasil ekstraksi menunjukan bahwa Xenia sp memiliki konsentrasi DNA yang tertinggi dengan nilai 53.90 (ng/ul) dan terendah pada jenis Sarcophyton trocheliophorum sebesar 26.70 (ng/ul). Optimalisasi PCR menghasilkan hasil yang baik pada spesies Xenia sp., dan Lobophytum pauciflorum sedangkan pada sampel jenis Sarcophyton trocheliophorum pita DNA menunjukan hasil yang smear.
Hasil ekstraksi setelah di ujikan pada nanodrop spektrofotmeter jenis Xenia sp memiliki konsentrasi DNA yang tertinggi dengan nilai 53.90 (ng/ul) dan terendah pada jenis Sarcophyton trocheliophorum sebesar 26.Tingginya konsentrasi DNA pada karang lunak jenis Xenia sp dimungkinkan karena dari karakter tissue karang ini yang lebih lunak sehingga mudah di ekstraksi sedangkan rendahnya konsentrasi DNA ini dimungkinkan karena adanya kontaminasi pada hasil ekstraksi.Optimalisasi PCR menghasilkan hasil yang baik pada spesies Xenia sp., dan Lobophytum pauciflorum sedangkan pada sampel jenis Sarcophyton trocheliophorum pita DNA menunjukan hasil yang smear.
Penelitian lanjutan dapat fokus pada pengembangan metode ekstraksi DNA alternatif untuk spesies karang lunak seperti Sarcophyton trocheliophorum yang memiliki hasil ekstraksi rendah dan kontaminasi tinggi. Selain itu, perlu dilakukan studi lebih lanjut tentang optimasi suhu annealing PCR untuk spesies yang menunjukkan hasil smear, seperti Sarcophyton trocheliophorum, agar diperoleh amplifikasi DNA yang lebih jelas dan akurat. Terakhir, penelitian juga dapat mengkaji pengaruh kondisi penyimpanan sampel karang lunak (misalnya suhu dan waktu penyimpanan) terhadap kualitas DNA yang dihasilkan, karena hal ini mungkin memengaruhi hasil ekstraksi dan PCR. Dengan menggabungkan pendekatan ini, diharapkan dapat meningkatkan efisiensi identifikasi molekuler karang lunak secara keseluruhan.
| File size | 603.04 KB |
| Pages | 8 |
| DMCA | Report |
Related /
UNUBLITARUNUBLITAR Penelitian ini menganalisis kinetika dan konversi ekstraksi dolomit menggunakan asam fosfat melalui metode ekstraksi padat‑cair. Proses awal, dolomitPenelitian ini menganalisis kinetika dan konversi ekstraksi dolomit menggunakan asam fosfat melalui metode ekstraksi padat‑cair. Proses awal, dolomit
POLTEKKES JAYAPURAPOLTEKKES JAYAPURA coli dan dua Klebsiella sp pada penderita infeksi saluran kemih, serta menemukan perbedaan signifikan dalam sensitivitas antibiotik Ciprofloxacin dan Cefiximecoli dan dua Klebsiella sp pada penderita infeksi saluran kemih, serta menemukan perbedaan signifikan dalam sensitivitas antibiotik Ciprofloxacin dan Cefixime
UMNUMN Namun, ada zat aktif lain yang bisa digunakan dalam pembuatan sabun pencuci secara alami, yaitu ekstrak sereh wangi dari tanaman sereh wangi. Oleh karenaNamun, ada zat aktif lain yang bisa digunakan dalam pembuatan sabun pencuci secara alami, yaitu ekstrak sereh wangi dari tanaman sereh wangi. Oleh karena
MEDIAPUBLIKASIMEDIAPUBLIKASI Berdasarkan hasil penelitian dapat disimpulkan bahwa jenis ikan karang di zona intertidal pantai Kondang Merak adalah 29 jenis termasuk dalam 15 famili,Berdasarkan hasil penelitian dapat disimpulkan bahwa jenis ikan karang di zona intertidal pantai Kondang Merak adalah 29 jenis termasuk dalam 15 famili,
UNJUNJ Untuk menjaga kelestarian ekosistem terumbu karang di pulau ini, perlu dilakukan penilaian kondisi kesehatannya secara berkala. Terumbu karang merupakanUntuk menjaga kelestarian ekosistem terumbu karang di pulau ini, perlu dilakukan penilaian kondisi kesehatannya secara berkala. Terumbu karang merupakan
EASTASOUTH INSTITUTEEASTASOUTH INSTITUTE Minyak atsiri ini berfungsi sebagai antimikroba, antiseptik, dan aromaterapi. Namun, potensi ekonomi daun sirih hijau belum dimanfaatkan secara optimalMinyak atsiri ini berfungsi sebagai antimikroba, antiseptik, dan aromaterapi. Namun, potensi ekonomi daun sirih hijau belum dimanfaatkan secara optimal
MAHADEWAMAHADEWA Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui potensi antibakteri pegagan terhadap berbagai bakteri, baik gram negatif maupun positif. Hasil dari review iniPenelitian ini bertujuan untuk mengetahui potensi antibakteri pegagan terhadap berbagai bakteri, baik gram negatif maupun positif. Hasil dari review ini
UNIBUNIB Pengambilan data di lapangan terbagi dalam dua tahap yaitu survey dan pengambilan data primer yang terdiri dari wawancara, pengisian kuesioner, dan ikutPengambilan data di lapangan terbagi dalam dua tahap yaitu survey dan pengambilan data primer yang terdiri dari wawancara, pengisian kuesioner, dan ikut
Useful /
PTIQPTIQ Pengelolaan kelas yang efektif memerlukan peran optimal guru sebagai tenaga profesional yang mampu meningkatkan mutu pendidikan nasional sesuai denganPengelolaan kelas yang efektif memerlukan peran optimal guru sebagai tenaga profesional yang mampu meningkatkan mutu pendidikan nasional sesuai dengan
EASTASOUTH INSTITUTEEASTASOUTH INSTITUTE Dakwah yang keberlanjutan itu penting sekali guna membentuk perilaku keseharian masyarakat. Kajian Al Quran-Hadits dalam pembacaan Ratib Al-Haddad, bisaDakwah yang keberlanjutan itu penting sekali guna membentuk perilaku keseharian masyarakat. Kajian Al Quran-Hadits dalam pembacaan Ratib Al-Haddad, bisa
UNUTARAUNUTARA Lingkungan budaya masyarakat tradisional kaya akan kearifan lokal, namun belum banyak diungkap bagaimana kearifan ini tumbuh dan terpelihara dalam kehidupanLingkungan budaya masyarakat tradisional kaya akan kearifan lokal, namun belum banyak diungkap bagaimana kearifan ini tumbuh dan terpelihara dalam kehidupan
DIM UNPASDIM UNPAS (2) seberapa besar pengaruh kepemimpinan situasional terhadap team work. (3) seberapa besar budaya organisasi berpengaruh terhadap team work. (4) seberapa(2) seberapa besar pengaruh kepemimpinan situasional terhadap team work. (3) seberapa besar budaya organisasi berpengaruh terhadap team work. (4) seberapa