UPGRISUPGRIS
Advance Sustainable Science, Engineering and TechnologyAdvance Sustainable Science, Engineering and TechnologyPemahaman tentang keragaman genetik, studi asosiasi, analisis evolusi, lokus sifat kuantitatif (QTL), seleksi berbantuan penanda (MAS), dan asosiasi genom luas (GWAS) pada tanaman tropis sangat penting untuk meningkatkan karakteristik tanaman demi ketahanan pangan di wilayah tropis. Penanda polimorfisme nukleotida tunggal (SNP) kini menjadi penanda molekuler paling populer untuk keperluan tersebut karena efisiensi dan akurasi yang lebih baik dibandingkan penanda molekuler lain. Melalui penanda SNP, gen-gen yang berhubungan dengan sifat agronomis, morfologis, fisiologis, serta ketahanan biotik dan abiotik dapat diidentifikasi dengan cepat dan andal. Ulasan ini menjelaskan metode penemuan SNP di dalam genom tanaman dan aplikasi marker SNP dalam pemuliaan tanaman tropis, termasuk padi, jagung, kacang, kentang, tomat, singkong, talas, dan tanaman tropis lainnya.
Informasi genomik tanaman yang diperoleh melalui analisis keragaman genetik, studi asosiasi, analisis evolusi, QTL, MAS, dan GWAS sangat bermanfaat dalam upaya meningkatkan ketahanan pangan.Untuk menghadapi perubahan iklim, pemuliaan tanaman unggul yang memanfaatkan informasi genomik dan marker SNP memungkinkan identifikasi gen terkait sifat penting secara efisien.Berbagai informasi genomik pada tanaman tropis telah diidentifikasi untuk meningkatkan karakteristik agronomis dan toleransi terhadap stres.
Pertama, penelitian lanjutan sebaiknya diarahkan untuk mengembangkan protokol penemuan SNP berbasis genotyping by sequencing (GBS) yang lebih hemat biaya dan mudah diimplementasikan untuk tanaman tropis dengan genom kompleks, seperti ubi jalar (Ipomoea batatas) dan talas (Colocasia esculenta). Metode ini perlu diuji pada berbagai sumber genetik agar dapat mengurangi jumlah data hilang dan meningkatkan cakupan serta kualitas marker SNP. Kedua, dibutuhkan pengembangan strategi imputasi data dan algoritma komputasi terintegrasi yang mampu meningkatkan akurasi pemanggilan SNP dalam dataset GBS populasi tropis yang memiliki keanekaragaman genetik tinggi serta heterozigositas yang kompleks. Model imputasi ini dapat mencakup pendekatan machine learning untuk memperkirakan alel yang hilang berdasarkan pola haplotipe lokal. Ketiga, studi selanjutnya dapat memanfaatkan SNP yang telah tervalidasi untuk melakukan genome-wide association study (GWAS) pada sifat toleransi stres abiotik—seperti kekeringan, salinitas, dan suhu tinggi—dalam panel tanaman tropis unggul, misalnya padi, jagung, dan singkong. Hasil GWAS ini dapat digunakan untuk mengidentifikasi marker fungsional yang berhubungan langsung dengan mekanisme adaptasi, sekaligus menyediakan dasar ilmiah bagi marker-assisted selection dalam program pemuliaan guna meningkatkan ketahanan varietas tropis di tengah perubahan iklim.
- High-Throughput SNP Genotyping to Accelerate Crop Improvement. high throughput genotyping accelerate... doi.org/10.9787/PBB.2014.2.3.195High Throughput SNP Genotyping to Accelerate Crop Improvement high throughput genotyping accelerate doi 10 9787 PBB 2014 2 3 195
- Development of Single Nucleotide Polymorphism (SNP) Markers in Tropical Crops | Dwiningsih | Advance... doi.org/10.26877/asset.v2i2.6279Development of Single Nucleotide Polymorphism SNP Markers in Tropical Crops Dwiningsih Advance doi 10 26877 asset v2i2 6279
- Single nucleotide polymorphism discovery in elite north american potato germplasm | BMC Genomics | Full... doi.org/10.1186/1471-2164-12-302Single nucleotide polymorphism discovery in elite north american potato germplasm BMC Genomics Full doi 10 1186 1471 2164 12 302
| File size | 468.72 KB |
| Pages | 14 |
| DMCA | Report |
Related /
FORMOSAPUBLISHERFORMOSAPUBLISHER Kultivar Pae Dai Ngalaru dengan penyediaan air 100% memberikan tinggi tanaman, jumlah anakan, bobot kering jaringan, serta hasil gabah terbaik dibandingKultivar Pae Dai Ngalaru dengan penyediaan air 100% memberikan tinggi tanaman, jumlah anakan, bobot kering jaringan, serta hasil gabah terbaik dibanding
UMKUNINGANUMKUNINGAN Ekstrak biji alpukat dan daun salam dapat diformulasikan menjadi sediaan jelly drink dengan konsentrasi karagenan (0,20%. Sediaan dengan konsentrasi karagenanEkstrak biji alpukat dan daun salam dapat diformulasikan menjadi sediaan jelly drink dengan konsentrasi karagenan (0,20%. Sediaan dengan konsentrasi karagenan
POLTEKKES MATARAMPOLTEKKES MATARAM Consumption of the PIKEBI Bar significantly reduced systolic blood pressure but did not affect diastolic blood pressure. Konsumsi PIKEBI Bar secara signifikanConsumption of the PIKEBI Bar significantly reduced systolic blood pressure but did not affect diastolic blood pressure. Konsumsi PIKEBI Bar secara signifikan
POLTEKKESDEPKES SBYPOLTEKKESDEPKES SBY 020), dan pengelolaan sampah (p = 0. 046) dengan kejadian stunting. Kesimpulannya, penelitian ini menemukan adanya asosiasi signifikan antara faktor sanitasi020), dan pengelolaan sampah (p = 0. 046) dengan kejadian stunting. Kesimpulannya, penelitian ini menemukan adanya asosiasi signifikan antara faktor sanitasi
UNIDHAUNIDHA Sistem pendukung keputusan pemilihan investasi saham telah dirancang dan dibangun menggunakan metode Extreme Programming serta TOPSIS untuk memberikanSistem pendukung keputusan pemilihan investasi saham telah dirancang dan dibangun menggunakan metode Extreme Programming serta TOPSIS untuk memberikan
UNIDHAUNIDHA Pengujian sistem menunjukkan semua fitur berfungsi sebagaimana mestinya, sehingga GIS ini dapat meningkatkan aksesibilitas tempat ibadah dan mempermudahPengujian sistem menunjukkan semua fitur berfungsi sebagaimana mestinya, sehingga GIS ini dapat meningkatkan aksesibilitas tempat ibadah dan mempermudah
UNUSAUNUSA Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi patogen yang terkait dengan bakteriuria asimtomatik di antara pasien diabetes dan antibiogram isolat tersebutPenelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi patogen yang terkait dengan bakteriuria asimtomatik di antara pasien diabetes dan antibiogram isolat tersebut
BALIMEDICALJOURNALBALIMEDICALJOURNAL Setelah perlakuan 60 hari, ditemukan peningkatan signifikan kadar kolesterol total, MDA, dan interleukin-1 pada kelompok hiperkolesterolemia. KelompokSetelah perlakuan 60 hari, ditemukan peningkatan signifikan kadar kolesterol total, MDA, dan interleukin-1 pada kelompok hiperkolesterolemia. Kelompok
Useful /
UNUSAUNUSA Metode organosolv menggunakan pelarut etanol 70% pada suhu 170 °C selama 3 jam. Hasil penelitian menunjukkan bahwa kertas yang dihasilkan memiliki gramaturMetode organosolv menggunakan pelarut etanol 70% pada suhu 170 °C selama 3 jam. Hasil penelitian menunjukkan bahwa kertas yang dihasilkan memiliki gramatur
QAUMIYYAHQAUMIYYAH Hal ini tidak terlepas dari majemuknya masyarakat Kota Palu serta latar belakang hingga berbagai masalah perkotaan yang menjadi penyebab meningkatnya angkaHal ini tidak terlepas dari majemuknya masyarakat Kota Palu serta latar belakang hingga berbagai masalah perkotaan yang menjadi penyebab meningkatnya angka
UPGRISUPGRIS Rekomendasi penelitian masa depan meliputi studi perbandingan antara kanal media sosial berbayar dan organik, serta evaluasi efektivitas iklan influencerRekomendasi penelitian masa depan meliputi studi perbandingan antara kanal media sosial berbayar dan organik, serta evaluasi efektivitas iklan influencer
UPGRISUPGRIS telah dilakukan. Keberadaan bakteri yang berasosiasi dengan Gracilaria sp. memungkinkan pemanfaatannya sebagai sumber senyawa bioaktif baru, seperti biopigmen.telah dilakukan. Keberadaan bakteri yang berasosiasi dengan Gracilaria sp. memungkinkan pemanfaatannya sebagai sumber senyawa bioaktif baru, seperti biopigmen.