UPGRISUPGRIS

Advance Sustainable Science, Engineering and TechnologyAdvance Sustainable Science, Engineering and Technology

Pemahaman tentang keragaman genetik, studi asosiasi, analisis evolusi, lokus sifat kuantitatif (QTL), seleksi berbantuan penanda (MAS), dan asosiasi genom luas (GWAS) pada tanaman tropis sangat penting untuk meningkatkan karakteristik tanaman demi ketahanan pangan di wilayah tropis. Penanda polimorfisme nukleotida tunggal (SNP) kini menjadi penanda molekuler paling populer untuk keperluan tersebut karena efisiensi dan akurasi yang lebih baik dibandingkan penanda molekuler lain. Melalui penanda SNP, gen-gen yang berhubungan dengan sifat agronomis, morfologis, fisiologis, serta ketahanan biotik dan abiotik dapat diidentifikasi dengan cepat dan andal. Ulasan ini menjelaskan metode penemuan SNP di dalam genom tanaman dan aplikasi marker SNP dalam pemuliaan tanaman tropis, termasuk padi, jagung, kacang, kentang, tomat, singkong, talas, dan tanaman tropis lainnya.

Informasi genomik tanaman yang diperoleh melalui analisis keragaman genetik, studi asosiasi, analisis evolusi, QTL, MAS, dan GWAS sangat bermanfaat dalam upaya meningkatkan ketahanan pangan.Untuk menghadapi perubahan iklim, pemuliaan tanaman unggul yang memanfaatkan informasi genomik dan marker SNP memungkinkan identifikasi gen terkait sifat penting secara efisien.Berbagai informasi genomik pada tanaman tropis telah diidentifikasi untuk meningkatkan karakteristik agronomis dan toleransi terhadap stres.

Pertama, penelitian lanjutan sebaiknya diarahkan untuk mengembangkan protokol penemuan SNP berbasis genotyping by sequencing (GBS) yang lebih hemat biaya dan mudah diimplementasikan untuk tanaman tropis dengan genom kompleks, seperti ubi jalar (Ipomoea batatas) dan talas (Colocasia esculenta). Metode ini perlu diuji pada berbagai sumber genetik agar dapat mengurangi jumlah data hilang dan meningkatkan cakupan serta kualitas marker SNP. Kedua, dibutuhkan pengembangan strategi imputasi data dan algoritma komputasi terintegrasi yang mampu meningkatkan akurasi pemanggilan SNP dalam dataset GBS populasi tropis yang memiliki keanekaragaman genetik tinggi serta heterozigositas yang kompleks. Model imputasi ini dapat mencakup pendekatan machine learning untuk memperkirakan alel yang hilang berdasarkan pola haplotipe lokal. Ketiga, studi selanjutnya dapat memanfaatkan SNP yang telah tervalidasi untuk melakukan genome-wide association study (GWAS) pada sifat toleransi stres abiotik—seperti kekeringan, salinitas, dan suhu tinggi—dalam panel tanaman tropis unggul, misalnya padi, jagung, dan singkong. Hasil GWAS ini dapat digunakan untuk mengidentifikasi marker fungsional yang berhubungan langsung dengan mekanisme adaptasi, sekaligus menyediakan dasar ilmiah bagi marker-assisted selection dalam program pemuliaan guna meningkatkan ketahanan varietas tropis di tengah perubahan iklim.

  1. High-Throughput SNP Genotyping to Accelerate Crop Improvement. high throughput genotyping accelerate... doi.org/10.9787/PBB.2014.2.3.195High Throughput SNP Genotyping to Accelerate Crop Improvement high throughput genotyping accelerate doi 10 9787 PBB 2014 2 3 195
  2. Development of Single Nucleotide Polymorphism (SNP) Markers in Tropical Crops | Dwiningsih | Advance... doi.org/10.26877/asset.v2i2.6279Development of Single Nucleotide Polymorphism SNP Markers in Tropical Crops Dwiningsih Advance doi 10 26877 asset v2i2 6279
  3. Single nucleotide polymorphism discovery in elite north american potato germplasm | BMC Genomics | Full... doi.org/10.1186/1471-2164-12-302Single nucleotide polymorphism discovery in elite north american potato germplasm BMC Genomics Full doi 10 1186 1471 2164 12 302
  1. #ubi jalar#ubi jalar
  2. #geographic information system#geographic information system
Read online
File size468.72 KB
Pages14
Short Linkhttps://juris.id/p-1M
Lookup LinksGoogle ScholarGoogle Scholar, Semantic ScholarSemantic Scholar, CORE.ac.ukCORE.ac.uk, WorldcatWorldcat, ZenodoZenodo, Research GateResearch Gate, Academia.eduAcademia.edu, OpenAlexOpenAlex, Hollis HarvardHollis Harvard
DMCAReport

Related /

JURIS A Bibliometric Study Recommendation based on Artificial Intelligence for iLearning Education 2025More at 2025

APTISIAPTISI Karena mayoritas mahasiswa memulai studinya secara daring, platform Learning Management System (LMS) banyak digunakan. Universitas dan perguruan tinggiKarena mayoritas mahasiswa memulai studinya secara daring, platform Learning Management System (LMS) banyak digunakan. Universitas dan perguruan tinggi

JURIS Evaluation Of Carrying Capacity Based On Land Capability Of Kulon Progo Regency As An Input For Spatial Planning In The New Aerotropolis Era 2025More at 2025

IPBIPB Era aerotropolis baru akibat pembangunan bandara di Kulon Progo telah merangsang perkembangan regional dan mengubah citra daerah dari yang semula pedesaanEra aerotropolis baru akibat pembangunan bandara di Kulon Progo telah merangsang perkembangan regional dan mengubah citra daerah dari yang semula pedesaan

JURIS Peningkatan Tujuan Pembangunan Berkelanjutan 6 Inovasi Tantangan dan Jalur untuk Air Bersih dan Sanitasi 2025More at 2025

CAHAYA ICCAHAYA IC Tujuan penelitian ini adalah menganalisis kondisi global air bersih dan sanitasi, mengidentifikasi tantangan utama, serta mengeksplorasi solusi dan strategiTujuan penelitian ini adalah menganalisis kondisi global air bersih dan sanitasi, mengidentifikasi tantangan utama, serta mengeksplorasi solusi dan strategi

JURIS Desain reklamasi air limbah dari sewerage system untuk kegiatan berkebun di Universitas Pertamina 2025More at 2025

IPBIPB Kualitas effluent yang diharapkan dari proses pengolahan adalah TDS 278 mg/L; TSS 1,3 mg/L; Kekeruhan 0,17 NTU; BOD5 0,63 mg/L; COD 6,12 mg/L; Fosfat totalKualitas effluent yang diharapkan dari proses pengolahan adalah TDS 278 mg/L; TSS 1,3 mg/L; Kekeruhan 0,17 NTU; BOD5 0,63 mg/L; COD 6,12 mg/L; Fosfat total

JURIS Hydroponic Vegetable Marketing Strategy in Pekanbaru An Empirical Research 2025More at 2025

JOURNALKEBERLANJUTANJOURNALKEBERLANJUTAN Metodologi kualitatif deskriptif dengan pendekatan studi kasus diaplikasikan menggunakan observasi, wawancara, dan dokumentasi untuk memperoleh pemahamanMetodologi kualitatif deskriptif dengan pendekatan studi kasus diaplikasikan menggunakan observasi, wawancara, dan dokumentasi untuk memperoleh pemahaman

JURIS Determinants of Public Trust and Willingness to Use Generic Drugs in Saudi Arabia A Cross Sectional Study 2025More at 2025

BALIMEDICALJOURNALBALIMEDICALJOURNAL Penelitian ini juga menemukan bahwa biaya merupakan faktor penting dalam mempengaruhi keputusan untuk menggunakan obat generik. Penelitian ini menunjukkanPenelitian ini juga menemukan bahwa biaya merupakan faktor penting dalam mempengaruhi keputusan untuk menggunakan obat generik. Penelitian ini menunjukkan

JURIS Real Time Road Damage Detection on Mobile Devices using TensorFlow Lite and Teachable Machine 2025More at 2025

IRPIIRPI The system identifies road damage types such as cracks, potholes, and uneven surfaces. The RDD2020 dataset is used for model training, with preprocessingThe system identifies road damage types such as cracks, potholes, and uneven surfaces. The RDD2020 dataset is used for model training, with preprocessing

JURIS Analysis Redox Reaction on Zinc Coating Thickness Test in Metal Processing Industry of Small and Medium Enterprises 2022More at 2022

JURNALFKIPUNTADJURNALFKIPUNTAD Flat washers have an internal diameter of 22.65 - 22. 7 mm. In comparison, the outer diameter is between 43.75 - 43.80. The redox reaction process usedFlat washers have an internal diameter of 22.65 - 22. 7 mm. In comparison, the outer diameter is between 43.75 - 43.80. The redox reaction process used

Useful /

JURIS The Influence of Accounting Understanding Accounting Digitalization and Human Resource Competence on the Quality of Financial Reports in Village Credit Institutions in Ubud District 2025More at 2025

JOURNALKEBERLANJUTANJOURNALKEBERLANJUTAN Unit analisis penelitian adalah organisasi yang diwakili oleh kepala LPD. Metode pengumpulan data menggunakan kuesioner dengan teknik analisis regresiUnit analisis penelitian adalah organisasi yang diwakili oleh kepala LPD. Metode pengumpulan data menggunakan kuesioner dengan teknik analisis regresi

JURIS Destination Image as a Mediator of the Influence of Service Quality on the Decision to Purchase Dolphin Tourism Services 2025More at 2025

JOURNALKEBERLANJUTANJOURNALKEBERLANJUTAN Based on the research results, service quality has a positive and significant effect on the decision to purchase a dolphin tour package. Moreover, serviceBased on the research results, service quality has a positive and significant effect on the decision to purchase a dolphin tour package. Moreover, service

JURIS The Effect of Disclosure of GHG Emissions Greenhouse Gas Carbon Performance and Company Age on Company Value 2025More at 2025

JOURNALKEBERLANJUTANJOURNALKEBERLANJUTAN Teknik pengambilan sampel menggunakan pendekatan purposive sampling, yaitu dengan metode pengambilan sampel berdasarkan kriteria tertentu yang ditetapkanTeknik pengambilan sampel menggunakan pendekatan purposive sampling, yaitu dengan metode pengambilan sampel berdasarkan kriteria tertentu yang ditetapkan

JURIS Comparison of Antioxidant Activity of Ethanolic Methanolic n Hexan and Aqueous Extract of Parkia speciosa Peel based on Half Maximal Inhibitory Concentration Through Free Radical Inhibition 2020More at 2020

UPGRISUPGRIS Ekstrak peti singkar Parkia speciosa dengan pelarut metanol menunjukkan aktivitas antioksidan tertinggi berdasarkan nilai IC50 76,92 ppm, sedangkanEkstrak peti singkar Parkia speciosa dengan pelarut metanol menunjukkan aktivitas antioksidan tertinggi berdasarkan nilai IC50 76,92 ppm, sedangkan

Subjects /

  1. #integrasi prinsip#integrasi prinsip
  2. #arus kas#arus kas
  3. #pengelolaan keuangan#pengelolaan keuangan
  4. #aplikasi manajemen#aplikasi manajemen
  5. #akuntansi biaya#akuntansi biaya
  6. #system budaya#system budaya
  7. #peran moderasi#peran moderasi
  8. #sanksi pajak#sanksi pajak

ads-block-test