UPGRISUPGRIS

Advance Sustainable Science, Engineering and TechnologyAdvance Sustainable Science, Engineering and Technology

Pemahaman tentang keragaman genetik, studi asosiasi, analisis evolusi, lokus sifat kuantitatif (QTL), seleksi berbantuan penanda (MAS), dan asosiasi genom luas (GWAS) pada tanaman tropis sangat penting untuk meningkatkan karakteristik tanaman demi ketahanan pangan di wilayah tropis. Penanda polimorfisme nukleotida tunggal (SNP) kini menjadi penanda molekuler paling populer untuk keperluan tersebut karena efisiensi dan akurasi yang lebih baik dibandingkan penanda molekuler lain. Melalui penanda SNP, gen-gen yang berhubungan dengan sifat agronomis, morfologis, fisiologis, serta ketahanan biotik dan abiotik dapat diidentifikasi dengan cepat dan andal. Ulasan ini menjelaskan metode penemuan SNP di dalam genom tanaman dan aplikasi marker SNP dalam pemuliaan tanaman tropis, termasuk padi, jagung, kacang, kentang, tomat, singkong, talas, dan tanaman tropis lainnya.

Informasi genomik tanaman yang diperoleh melalui analisis keragaman genetik, studi asosiasi, analisis evolusi, QTL, MAS, dan GWAS sangat bermanfaat dalam upaya meningkatkan ketahanan pangan.Untuk menghadapi perubahan iklim, pemuliaan tanaman unggul yang memanfaatkan informasi genomik dan marker SNP memungkinkan identifikasi gen terkait sifat penting secara efisien.Berbagai informasi genomik pada tanaman tropis telah diidentifikasi untuk meningkatkan karakteristik agronomis dan toleransi terhadap stres.

Pertama, penelitian lanjutan sebaiknya diarahkan untuk mengembangkan protokol penemuan SNP berbasis genotyping by sequencing (GBS) yang lebih hemat biaya dan mudah diimplementasikan untuk tanaman tropis dengan genom kompleks, seperti ubi jalar (Ipomoea batatas) dan talas (Colocasia esculenta). Metode ini perlu diuji pada berbagai sumber genetik agar dapat mengurangi jumlah data hilang dan meningkatkan cakupan serta kualitas marker SNP. Kedua, dibutuhkan pengembangan strategi imputasi data dan algoritma komputasi terintegrasi yang mampu meningkatkan akurasi pemanggilan SNP dalam dataset GBS populasi tropis yang memiliki keanekaragaman genetik tinggi serta heterozigositas yang kompleks. Model imputasi ini dapat mencakup pendekatan machine learning untuk memperkirakan alel yang hilang berdasarkan pola haplotipe lokal. Ketiga, studi selanjutnya dapat memanfaatkan SNP yang telah tervalidasi untuk melakukan genome-wide association study (GWAS) pada sifat toleransi stres abiotik—seperti kekeringan, salinitas, dan suhu tinggi—dalam panel tanaman tropis unggul, misalnya padi, jagung, dan singkong. Hasil GWAS ini dapat digunakan untuk mengidentifikasi marker fungsional yang berhubungan langsung dengan mekanisme adaptasi, sekaligus menyediakan dasar ilmiah bagi marker-assisted selection dalam program pemuliaan guna meningkatkan ketahanan varietas tropis di tengah perubahan iklim.

  1. High-Throughput SNP Genotyping to Accelerate Crop Improvement. high throughput genotyping accelerate... doi.org/10.9787/PBB.2014.2.3.195High Throughput SNP Genotyping to Accelerate Crop Improvement high throughput genotyping accelerate doi 10 9787 PBB 2014 2 3 195
  2. Development of Single Nucleotide Polymorphism (SNP) Markers in Tropical Crops | Dwiningsih | Advance... doi.org/10.26877/asset.v2i2.6279Development of Single Nucleotide Polymorphism SNP Markers in Tropical Crops Dwiningsih Advance doi 10 26877 asset v2i2 6279
  3. Single nucleotide polymorphism discovery in elite north american potato germplasm | BMC Genomics | Full... doi.org/10.1186/1471-2164-12-302Single nucleotide polymorphism discovery in elite north american potato germplasm BMC Genomics Full doi 10 1186 1471 2164 12 302
Read online
File size468.72 KB
Pages14
DMCAReport

Related /

JURIS A Bibliometric Study Recommendation based on Artificial Intelligence for iLearning Education 2025More at 2025

APTISIAPTISI Platform Learning Management System (LMS) secara luas digunakan karena sebagian besar mahasiswa memulai studinya secara daring. Penelitian ini mengembangkanPlatform Learning Management System (LMS) secara luas digunakan karena sebagian besar mahasiswa memulai studinya secara daring. Penelitian ini mengembangkan

JURIS DICO JALF v 1 0 Diponegoro Corpus of Japanese Learners as a Foreign Language in Indonesia with AI Error Annotation and Human Supervision 2025More at 2025

UNANDUNAND Korpus ini berfungsi sebagai sumber dasar untuk penelitian masa depan tentang analisis kesalahan bantuan AI dalam konteks pembelajaran JFL di Indonesia.Korpus ini berfungsi sebagai sumber dasar untuk penelitian masa depan tentang analisis kesalahan bantuan AI dalam konteks pembelajaran JFL di Indonesia.

JURIS Evaluasi Efektivitas Sistem Rekomendasi Pembelajaran Adaptif Berbasis Deep Learning Dalam Meningkatkan Performa Siswa 2025More at 2025

MEDIAPUBLIKASIMEDIAPUBLIKASI Hasil evaluasi menunjukkan bahwa siswa yang menggunakan sistem ini mengalami peningkatan nilai akhir dan tingkat penyelesaian materi secara signifikan.Hasil evaluasi menunjukkan bahwa siswa yang menggunakan sistem ini mengalami peningkatan nilai akhir dan tingkat penyelesaian materi secara signifikan.

JURIS Desain Simulasi Cisco Pada Studi Kasus Optical Transport Network OTN 2023More at 2023

ALIMSPUBLISHINGALIMSPUBLISHING 2. Jaringan optik menyediakan arsitektur tanpa sentuhan untuk pipa bandwidth tinggi dan cepat, meskipun lalu lintas klien masih memiliki bit rate yang2. Jaringan optik menyediakan arsitektur tanpa sentuhan untuk pipa bandwidth tinggi dan cepat, meskipun lalu lintas klien masih memiliki bit rate yang

JURIS Evidence of Greenwashing in Talent Attraction Can Job Seekers Successfully Detect Deceptive Job Advertisements 2022More at 2022

JIS INSTITUTEJIS INSTITUTE The study demonstrates that green marketings effectiveness depends on a companys perceived green identity, with genuine green initiatives yielding theThe study demonstrates that green marketings effectiveness depends on a companys perceived green identity, with genuine green initiatives yielding the

JURIS The Legal Reform Policy on the Shariah Supervisory Board Role s in Indonesian Shariah Banks 2021More at 2021

UNSUNS pertama, tidak semua unit bisnis Islam memiliki dasar hukum kuat yang mendasari operasi Dewan Pengawas Syariah. kedua, keanggotaan Dewan Pengawas Syariahpertama, tidak semua unit bisnis Islam memiliki dasar hukum kuat yang mendasari operasi Dewan Pengawas Syariah. kedua, keanggotaan Dewan Pengawas Syariah

JURIS The Potential of Mechanic Vibration for Generating Electric Energy 2020More at 2020

UPGRISUPGRIS Penelitian ini menunjukkan bahwa vibrasi mekanik dapat dikonversi menjadi energi listrik. Selain itu, untuk mengisi ulang baterai isi ulang 1,2 V denganPenelitian ini menunjukkan bahwa vibrasi mekanik dapat dikonversi menjadi energi listrik. Selain itu, untuk mengisi ulang baterai isi ulang 1,2 V dengan

JURIS Pelatihan Pengelolaan Website Jurusan Bagi Staf Pengajar Dan Staf Administrasi Pada Jurusan Teknik Mesin Politeknik Negeri Lhokseumawe 2019More at 2019

PNLPNL Pelatihan pengelolaan website berhasil meningkatkan kemampuan peserta dalam mengelola data pribadi di website jurusan, yang ditunjukkan oleh peningkatanPelatihan pengelolaan website berhasil meningkatkan kemampuan peserta dalam mengelola data pribadi di website jurusan, yang ditunjukkan oleh peningkatan

Useful /

JURIS Pelatihan Pembuatan Kulkas Pot Tanpa Listrik Dari Tanah Liat Sebagai Penyimpanan Dingin Sayur Dan Buah 2026More at 2026

PNLPNL Selama ini, petani dan pedagang menyimpan sayur dan buah di gudang atau diletakkan begitu saja sehingga cepat layu dan membusuk. Solusi yang ditawarkanSelama ini, petani dan pedagang menyimpan sayur dan buah di gudang atau diletakkan begitu saja sehingga cepat layu dan membusuk. Solusi yang ditawarkan

JURIS The Legal Policy of Executability in the International Arbitral Tribunal Decision 2021More at 2021

UNSUNS Ketiga, berdasarkan Pasal 38 ayat (2) Aturan Arbitrase, tribun dapat melaksanakan kewenangan reconsideration ketika menemukan fakta baru yang secara krusialKetiga, berdasarkan Pasal 38 ayat (2) Aturan Arbitrase, tribun dapat melaksanakan kewenangan reconsideration ketika menemukan fakta baru yang secara krusial

JURIS Growth Performance of Daphnia sp Cultured in Different Concentration of Rice Washing Water 2020More at 2020

UPGRISUPGRIS Pengumpulan data dilakukan dengan wawancara mendalam dan observasi partisipatif. Validasi data menggunakan triangulasi sumber dan triangulasi teknik. AnalisisPengumpulan data dilakukan dengan wawancara mendalam dan observasi partisipatif. Validasi data menggunakan triangulasi sumber dan triangulasi teknik. Analisis

JURIS Program Kemitraan Masyarakat Bagi Kelompok Guru Tk Ra Melalui Pelatihan Pembuatan Alat Peraga Edukatif Berbasis Nilai Nilai Islam Di Kota Lhokseumawe 2019More at 2019

PNLPNL Permasalahan yang dihadapi mitra saat ini adalah masih minimnya sarana dan prasarana penunjang pembelajaran, seperti sarana bermain dan alat peraga/permainanPermasalahan yang dihadapi mitra saat ini adalah masih minimnya sarana dan prasarana penunjang pembelajaran, seperti sarana bermain dan alat peraga/permainan

ads-block-test