UNISDAUNISDA
MathScience: Jurnal Matematika dan Ilmu KomputerMathScience: Jurnal Matematika dan Ilmu KomputerSalah satu metode yang dapat digunakan untuk mengkonstruksi pohon filogenetik adalah maximum likelihood method. Penelitian ini dilakukan untuk mengetahui bagaimana mengidentifikasi suatu penyebaran virus covid varian E.G.5 menggunakan metode maximum likelihood. Hasil analisa jaringan wilayah mutasi menunjukkan bahwa penyebaran epidemi Covid-19 E.G.5 berasal dari Jakarta Selatan (EPI_ISL_17664319) dan dari analisis pohon filogenetik dengan maximum likelihood diketahui ada 16 klad dengan 6 klad besar pada kluster penyebaran virus covid-19 varian E.G.5.
Konstruksi filogenetik menggunakan maksimum likelihood ini dapat diterapkan pada kasus penyebaran covid-19 varian E.Metode berbasis probabilitas ini memungkinkan untuk akuisisi banyak topologi pohon dan karenanya memerlukan metode pencarian heuristik untuk mempersingkat waktu dalam memperoleh pohon filogenetik dengan nilai kemungkinan tertinggi.Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa nilai maksimum likelihood sebesar -44725.41544 dan terbagi menjadi 16 klad dengan 6 klad besar dalam cluster penyebaran virus covid-19 var E.Nilai ini digunakan untuk menentukan pohon mana yang dapat menjelaskan penyelarasan sequence dengan baik.Gambar 2 menunjukkan penyebaran awal epidemi covid-19 var E.5 dimulai dari Jakarta, karena jarak genetik antara Jakarta (EPI_ISL_17664319) dengan Jakarta (EPI_ISL_17623747) yaitu bernilai 0,0000 th.Dan untuk analisis multiple alignment menunjukkan terdapat daerah tidak stabil sebesar 5.360, dimana terjadi mutasi dengan nomor nukleotida yang berbeda.Hasil analisa jaringan wilayah mutasi menunjukkan bahwa penyebaran epidermi Covid-19 E.5 berasal dari Jakarta Selatan dan mulai menyebar ke daerah sekitar Jakarta dan berlanjut ke Bali, Surabaya, Bandung, dan Pekanbaru.
Untuk penelitian lanjutan, dapat dilakukan analisis lebih mendalam mengenai faktor-faktor yang mempengaruhi penyebaran virus covid-19 varian E.G.5 di Indonesia. Selain itu, studi komparatif antara metode maximum likelihood dengan metode lainnya dalam mengidentifikasi penyebaran virus dapat dilakukan untuk mengetahui keunggulan dan keterbatasan masing-masing metode. Terakhir, penelitian tentang dinamika mutasi pada virus covid-19 varian E.G.5 dan hubungannya dengan penyebaran virus dapat menjadi arah studi yang menarik untuk dilakukan.
- Maximum Likelihood Method on The Construction of Phylogenetic Tree for Identification the Spreading of... ieeexplore.ieee.org/document/8673334Maximum Likelihood Method on The Construction of Phylogenetic Tree for Identification the Spreading of ieeexplore ieee document 8673334
- Multiple alignment analysis on phylogenetic tree of the spread of SARS epidemic using distance method... doi.org/10.1088/1742-6596/890/1/012080Multiple alignment analysis on phylogenetic tree of the spread of SARS epidemic using distance method doi 10 1088 1742 6596 890 1 012080
| File size | 1.06 MB |
| Pages | 18 |
| DMCA | Report |
Related /
UIN WALISONGOUIN WALISONGO Originalitas – Keaslian studi ini terletak pada kerangka kerja terintegrasi yang menanalisis secara bersamaan faktor tradisional dan faktor baru, memberikanOriginalitas – Keaslian studi ini terletak pada kerangka kerja terintegrasi yang menanalisis secara bersamaan faktor tradisional dan faktor baru, memberikan
IPBIPB Pemanfaatan citra Landsat 5 dan Landsat 8 melalui analisis terawasi mampu menunjukkan perubahan pemanfaatan lahan selama 15 tahun pasca-tsunami di BandaPemanfaatan citra Landsat 5 dan Landsat 8 melalui analisis terawasi mampu menunjukkan perubahan pemanfaatan lahan selama 15 tahun pasca-tsunami di Banda
UNISDAUNISDA Bahasa gaul telah menjadi bagian dari komunikasi sehari-hari, terutama di kalangan siswa sekolah dasar yang aktif menggunakan media sosial. Fenomena iniBahasa gaul telah menjadi bagian dari komunikasi sehari-hari, terutama di kalangan siswa sekolah dasar yang aktif menggunakan media sosial. Fenomena ini
UNISDAUNISDA Berdasarkan penelitian di atas, penerapan pembelajaran berdiferensiasi pada pembelajaran memahami informasi teks cerita sederhana di kelas 5 SD menunjukkanBerdasarkan penelitian di atas, penerapan pembelajaran berdiferensiasi pada pembelajaran memahami informasi teks cerita sederhana di kelas 5 SD menunjukkan
BINUSBINUS Bisnis keluarga di keempat negara menghadapi tantangan yang relatif sama. Selanjutnya, sebagian besar studi di keempat negara ini terutama berfokus padaBisnis keluarga di keempat negara menghadapi tantangan yang relatif sama. Selanjutnya, sebagian besar studi di keempat negara ini terutama berfokus pada
UMSUMS Hasil menunjukkan bahwa efek banjir lebih intensif pada vegetasi, dengan penurunan 1,62%, 4,60%, 23,05%, dan 6,43% wilayah vegetasi pada tahun 1999, 2009,Hasil menunjukkan bahwa efek banjir lebih intensif pada vegetasi, dengan penurunan 1,62%, 4,60%, 23,05%, dan 6,43% wilayah vegetasi pada tahun 1999, 2009,
ISI YogyakartaISI Yogyakarta Ultimately, the analysis reveals that stereotypical depictions of Black people persist even in films aiming for empowerment, highlighting the need forUltimately, the analysis reveals that stereotypical depictions of Black people persist even in films aiming for empowerment, highlighting the need for
UGMUGM Selain itu, kondisi Marshall‑Lerner terpenuhi bagi Malaysia dan Thailand, sementara bagi Filipina dan Indonesia jumlah elastisitas harga kurang dariSelain itu, kondisi Marshall‑Lerner terpenuhi bagi Malaysia dan Thailand, sementara bagi Filipina dan Indonesia jumlah elastisitas harga kurang dari
Useful /
UIN WALISONGOUIN WALISONGO Ulasan menunjukkan bahwa integrasi perbankan Islam dengan inklusi keuangan di negara berkembang dapat dicapai melalui kombinasi kebijakan regulasi yangUlasan menunjukkan bahwa integrasi perbankan Islam dengan inklusi keuangan di negara berkembang dapat dicapai melalui kombinasi kebijakan regulasi yang
BCRECBCREC The basic nature of MgO contributed to the retro-aldol of NAG, and Ag species catalyzed the oxidation of intermediate to AcGly. The spent catalyst couldThe basic nature of MgO contributed to the retro-aldol of NAG, and Ag species catalyzed the oxidation of intermediate to AcGly. The spent catalyst could
BINUSBINUS Visi Saudi 2030 telah memicu transformasi ibadah Haji dan Umrah di Kerajaan Arab Saudi (KSA), memberikan peluang investasi yang menguntungkan bagi investorVisi Saudi 2030 telah memicu transformasi ibadah Haji dan Umrah di Kerajaan Arab Saudi (KSA), memberikan peluang investasi yang menguntungkan bagi investor
IAIN CURUPIAIN CURUP Analisis mengungkap bahwa kejahatan klasik seperti qadhf, ghibah, buhtan, dan namimah kini muncul dalam bentuk digital, namun sebagian besar negara mayoritasAnalisis mengungkap bahwa kejahatan klasik seperti qadhf, ghibah, buhtan, dan namimah kini muncul dalam bentuk digital, namun sebagian besar negara mayoritas