UNISDAUNISDA
MathScience: Jurnal Matematika dan Ilmu KomputerMathScience: Jurnal Matematika dan Ilmu KomputerSalah satu metode yang dapat digunakan untuk mengkonstruksi pohon filogenetik adalah maximum likelihood method. Penelitian ini dilakukan untuk mengetahui bagaimana mengidentifikasi suatu penyebaran virus covid varian E.G.5 menggunakan metode maximum likelihood. Hasil analisa jaringan wilayah mutasi menunjukkan bahwa penyebaran epidemi Covid-19 E.G.5 berasal dari Jakarta Selatan (EPI_ISL_17664319) dan dari analisis pohon filogenetik dengan maximum likelihood diketahui ada 16 klad dengan 6 klad besar pada kluster penyebaran virus covid-19 varian E.G.5.
Konstruksi filogenetik menggunakan maksimum likelihood ini dapat diterapkan pada kasus penyebaran covid-19 varian E.Metode berbasis probabilitas ini memungkinkan untuk akuisisi banyak topologi pohon dan karenanya memerlukan metode pencarian heuristik untuk mempersingkat waktu dalam memperoleh pohon filogenetik dengan nilai kemungkinan tertinggi.Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa nilai maksimum likelihood sebesar -44725.41544 dan terbagi menjadi 16 klad dengan 6 klad besar dalam cluster penyebaran virus covid-19 var E.Nilai ini digunakan untuk menentukan pohon mana yang dapat menjelaskan penyelarasan sequence dengan baik.Gambar 2 menunjukkan penyebaran awal epidemi covid-19 var E.5 dimulai dari Jakarta, karena jarak genetik antara Jakarta (EPI_ISL_17664319) dengan Jakarta (EPI_ISL_17623747) yaitu bernilai 0,0000 th.Dan untuk analisis multiple alignment menunjukkan terdapat daerah tidak stabil sebesar 5.360, dimana terjadi mutasi dengan nomor nukleotida yang berbeda.Hasil analisa jaringan wilayah mutasi menunjukkan bahwa penyebaran epidermi Covid-19 E.5 berasal dari Jakarta Selatan dan mulai menyebar ke daerah sekitar Jakarta dan berlanjut ke Bali, Surabaya, Bandung, dan Pekanbaru.
Untuk penelitian lanjutan, dapat dilakukan analisis lebih mendalam mengenai faktor-faktor yang mempengaruhi penyebaran virus covid-19 varian E.G.5 di Indonesia. Selain itu, studi komparatif antara metode maximum likelihood dengan metode lainnya dalam mengidentifikasi penyebaran virus dapat dilakukan untuk mengetahui keunggulan dan keterbatasan masing-masing metode. Terakhir, penelitian tentang dinamika mutasi pada virus covid-19 varian E.G.5 dan hubungannya dengan penyebaran virus dapat menjadi arah studi yang menarik untuk dilakukan.
- Maximum Likelihood Method on The Construction of Phylogenetic Tree for Identification the Spreading of... ieeexplore.ieee.org/document/8673334Maximum Likelihood Method on The Construction of Phylogenetic Tree for Identification the Spreading of ieeexplore ieee document 8673334
- Multiple alignment analysis on phylogenetic tree of the spread of SARS epidemic using distance method... doi.org/10.1088/1742-6596/890/1/012080Multiple alignment analysis on phylogenetic tree of the spread of SARS epidemic using distance method doi 10 1088 1742 6596 890 1 012080
| File size | 1.06 MB |
| Pages | 18 |
| DMCA | Report |
Related /
UNISDAUNISDA Media sosial memainkan peran besar dalam penyebaran istilah-istilah ini, terutama melalui tren dan konten kreator. Dari segi struktur kalimat, siswa cenderungMedia sosial memainkan peran besar dalam penyebaran istilah-istilah ini, terutama melalui tren dan konten kreator. Dari segi struktur kalimat, siswa cenderung
UNISDAUNISDA Hal ini dikarenakan media Manasik di desain dengan menggunakan pewarnaan dan gambar yang menarik peserta didik. Sehingga media Manasik dinyatakan layakHal ini dikarenakan media Manasik di desain dengan menggunakan pewarnaan dan gambar yang menarik peserta didik. Sehingga media Manasik dinyatakan layak
UNISDAUNISDA Hasil validitas menunjukkan skor rata-rata 4,96 dari validator media dan ahli, dengan respon guru 4,96 dan respon siswa positif 97,00%. Media Games WordwallHasil validitas menunjukkan skor rata-rata 4,96 dari validator media dan ahli, dengan respon guru 4,96 dan respon siswa positif 97,00%. Media Games Wordwall
UNISDAUNISDA Metode yang digunakan adalah Research and Development (RnD) dengan model ADDIE (Analyze, Design, Development, Implement, Evaluate). Pengumpulan data dilakukanMetode yang digunakan adalah Research and Development (RnD) dengan model ADDIE (Analyze, Design, Development, Implement, Evaluate). Pengumpulan data dilakukan
UNISDAUNISDA Siswa dengan Self-Efficacy tinggi menunjukkan keberhasilan dalam pemecahan masalah, siswa dengan Self-Efficacy sedang kurang maksimal dalam pemeriksaan,Siswa dengan Self-Efficacy tinggi menunjukkan keberhasilan dalam pemecahan masalah, siswa dengan Self-Efficacy sedang kurang maksimal dalam pemeriksaan,
BINUSBINUS Dari tinjauan literatur sistemik, penelitian ini menemukan bahwa bisnis keluarga di Asia Tenggara menghadapi tantangan yang berbeda karena berbagai pengaturanDari tinjauan literatur sistemik, penelitian ini menemukan bahwa bisnis keluarga di Asia Tenggara menghadapi tantangan yang berbeda karena berbagai pengaturan
ISI YogyakartaISI Yogyakarta movies is still problematic, as these films often perpetuate stereotypes depicting Black people as disrespectful and unintelligent compared to other races.movies is still problematic, as these films often perpetuate stereotypes depicting Black people as disrespectful and unintelligent compared to other races.
UGMUGM Permintaan ekspor dan impor diperkirakan sebelum krisis moneter muncul (1963‑1995) menggunakan metode Dynamic OLS (DOLS), sementara pendekatan JohansenPermintaan ekspor dan impor diperkirakan sebelum krisis moneter muncul (1963‑1995) menggunakan metode Dynamic OLS (DOLS), sementara pendekatan Johansen
Useful /
BCRECBCREC Komposit ZnO/TiO2 menunjukkan kinerja fotokatalitik yang ditingkatkan dibandingkan dengan ZnO murni, terutama dalam kondisi kelembaban tinggi. PenemuanKomposit ZnO/TiO2 menunjukkan kinerja fotokatalitik yang ditingkatkan dibandingkan dengan ZnO murni, terutama dalam kondisi kelembaban tinggi. Penemuan
UNISDAUNISDA Penelitian ini bertujuan (1) Untuk mengetahui proses pengembangan media kartu pintar dengan berbantuan aplikasi lumi untuk pembelajaran menulis puisi padaPenelitian ini bertujuan (1) Untuk mengetahui proses pengembangan media kartu pintar dengan berbantuan aplikasi lumi untuk pembelajaran menulis puisi pada
UNISDAUNISDA Subjek penelitian ini sebanyak 52 siswa yang terdiri dari 26 siswa kelas eksperimen dan 26 siswa kelas kontrol yang diperoleh dengan menggunakan teknikSubjek penelitian ini sebanyak 52 siswa yang terdiri dari 26 siswa kelas eksperimen dan 26 siswa kelas kontrol yang diperoleh dengan menggunakan teknik
POLTEKBAPOLTEKBA Perbandingan agregat halus dan kasar 30%: 70%. Beton dengan fas 0,4, 0,5, dan 0,6 menghasilkan kuat tekan rata‑rata 51,263–26,639 MPa sesuai w/c,Perbandingan agregat halus dan kasar 30%: 70%. Beton dengan fas 0,4, 0,5, dan 0,6 menghasilkan kuat tekan rata‑rata 51,263–26,639 MPa sesuai w/c,