UNISDAUNISDA
MathScience: Jurnal Matematika dan Ilmu KomputerMathScience: Jurnal Matematika dan Ilmu KomputerSalah satu metode yang dapat digunakan untuk mengkonstruksi pohon filogenetik adalah maximum likelihood method. Penelitian ini dilakukan untuk mengetahui bagaimana mengidentifikasi suatu penyebaran virus covid varian E.G.5 menggunakan metode maximum likelihood. Hasil analisa jaringan wilayah mutasi menunjukkan bahwa penyebaran epidemi Covid-19 E.G.5 berasal dari Jakarta Selatan (EPI_ISL_17664319) dan dari analisis pohon filogenetik dengan maximum likelihood diketahui ada 16 klad dengan 6 klad besar pada kluster penyebaran virus covid-19 varian E.G.5.
Konstruksi filogenetik menggunakan maksimum likelihood ini dapat diterapkan pada kasus penyebaran covid-19 varian E.Metode berbasis probabilitas ini memungkinkan untuk akuisisi banyak topologi pohon dan karenanya memerlukan metode pencarian heuristik untuk mempersingkat waktu dalam memperoleh pohon filogenetik dengan nilai kemungkinan tertinggi.Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa nilai maksimum likelihood sebesar -44725.41544 dan terbagi menjadi 16 klad dengan 6 klad besar dalam cluster penyebaran virus covid-19 var E.Nilai ini digunakan untuk menentukan pohon mana yang dapat menjelaskan penyelarasan sequence dengan baik.Gambar 2 menunjukkan penyebaran awal epidemi covid-19 var E.5 dimulai dari Jakarta, karena jarak genetik antara Jakarta (EPI_ISL_17664319) dengan Jakarta (EPI_ISL_17623747) yaitu bernilai 0,0000 th.Dan untuk analisis multiple alignment menunjukkan terdapat daerah tidak stabil sebesar 5.360, dimana terjadi mutasi dengan nomor nukleotida yang berbeda.Hasil analisa jaringan wilayah mutasi menunjukkan bahwa penyebaran epidermi Covid-19 E.5 berasal dari Jakarta Selatan dan mulai menyebar ke daerah sekitar Jakarta dan berlanjut ke Bali, Surabaya, Bandung, dan Pekanbaru.
Untuk penelitian lanjutan, dapat dilakukan analisis lebih mendalam mengenai faktor-faktor yang mempengaruhi penyebaran virus covid-19 varian E.G.5 di Indonesia. Selain itu, studi komparatif antara metode maximum likelihood dengan metode lainnya dalam mengidentifikasi penyebaran virus dapat dilakukan untuk mengetahui keunggulan dan keterbatasan masing-masing metode. Terakhir, penelitian tentang dinamika mutasi pada virus covid-19 varian E.G.5 dan hubungannya dengan penyebaran virus dapat menjadi arah studi yang menarik untuk dilakukan.
- Maximum Likelihood Method on The Construction of Phylogenetic Tree for Identification the Spreading of... ieeexplore.ieee.org/document/8673334Maximum Likelihood Method on The Construction of Phylogenetic Tree for Identification the Spreading of ieeexplore ieee document 8673334
- Multiple alignment analysis on phylogenetic tree of the spread of SARS epidemic using distance method... doi.org/10.1088/1742-6596/890/1/012080Multiple alignment analysis on phylogenetic tree of the spread of SARS epidemic using distance method doi 10 1088 1742 6596 890 1 012080
| File size | 1.06 MB |
| Pages | 18 |
| DMCA | Report |
Related /
IPDNIPDN Penelitian bertujuan untuk mengetahui dan mendeskripsikan strategi pengembangan BUMDes Tarumajaya di Desa Tarumajaya, Kecamatan Kertasari, Kabupaten Bandung.Penelitian bertujuan untuk mengetahui dan mendeskripsikan strategi pengembangan BUMDes Tarumajaya di Desa Tarumajaya, Kecamatan Kertasari, Kabupaten Bandung.
IPDNIPDN Selain itu, wawancara dengan pemangku kepentingan lokal dilakukan untuk menggali kapasitas adaptasi masyarakat. Hasil penelitian menunjukkan bahwa wilayahSelain itu, wawancara dengan pemangku kepentingan lokal dilakukan untuk menggali kapasitas adaptasi masyarakat. Hasil penelitian menunjukkan bahwa wilayah
IPDNIPDN Prinsip kesetaraan menunjukan bahwa para keluarga penerima manfaat yang sebelumnya kesulitan dalam memenuhi kebutuhan sehari, kesulitan mendapatkan fasilitasPrinsip kesetaraan menunjukan bahwa para keluarga penerima manfaat yang sebelumnya kesulitan dalam memenuhi kebutuhan sehari, kesulitan mendapatkan fasilitas
IPDNIPDN Implikasi akademiknya, penelitian ini mengisi celah literatur dengan memberikan wawasan mendalam mengenai dinamika implementasi smart governance di wilayahImplikasi akademiknya, penelitian ini mengisi celah literatur dengan memberikan wawasan mendalam mengenai dinamika implementasi smart governance di wilayah
POLNAMPOLNAM Penelitian ini menggunakan pendekatan kuantitatif dengan metode survei terhadap 100 orang masyarakat kota Ambon. Data dianalisis dengan mempergunakan regresiPenelitian ini menggunakan pendekatan kuantitatif dengan metode survei terhadap 100 orang masyarakat kota Ambon. Data dianalisis dengan mempergunakan regresi
POLNAMPOLNAM Hasil analisis menunjukan bahwa lokasi usaha memiliki pengaruh sebesar 99,1% sedangkan sisanya sebesar 0,9% dipengaruhi oleh variabel lain yang tidak diikutkanHasil analisis menunjukan bahwa lokasi usaha memiliki pengaruh sebesar 99,1% sedangkan sisanya sebesar 0,9% dipengaruhi oleh variabel lain yang tidak diikutkan
POLNAMPOLNAM 59/org, Kampung Mogibi dengan total rata-rata biaya Rp. 96/org, Kampung Siri-siri dengan total biaya rata-rata Rp. 55/org, Kampung Sibae dengan total biaya59/org, Kampung Mogibi dengan total rata-rata biaya Rp. 96/org, Kampung Siri-siri dengan total biaya rata-rata Rp. 55/org, Kampung Sibae dengan total biaya
POLNAMPOLNAM 8 kg. Penelitian ini menyimpulkan bahwa terdapat lima jenis sagu berdasarkan penamaan lokal masyarakat di Distrik Kais, yaitu Raimamare, Kororo, Mugici,8 kg. Penelitian ini menyimpulkan bahwa terdapat lima jenis sagu berdasarkan penamaan lokal masyarakat di Distrik Kais, yaitu Raimamare, Kororo, Mugici,
Useful /
UNISDAUNISDA Berdasarkan hasil penelitian ini disimpulkan bahwa perempuan/istri masih memeiliki kemampuan untuk memperjuangkan hak-haknya. Karena itu diharap kan kepadaBerdasarkan hasil penelitian ini disimpulkan bahwa perempuan/istri masih memeiliki kemampuan untuk memperjuangkan hak-haknya. Karena itu diharap kan kepada
UNWAHAUNWAHA Hal ini karena bank syariah perlu menemukan cara baru untuk mengelola risiko karena pembiayaan mudharabah dianggap berisiko. Sementara itu, pembiayaanHal ini karena bank syariah perlu menemukan cara baru untuk mengelola risiko karena pembiayaan mudharabah dianggap berisiko. Sementara itu, pembiayaan
UNWAHAUNWAHA Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis efektivitas strategi promosi dalam meningkatkan penjualan produk Kredit Pemilikan Rumah (KPR) subsidi di tengahPenelitian ini bertujuan untuk menganalisis efektivitas strategi promosi dalam meningkatkan penjualan produk Kredit Pemilikan Rumah (KPR) subsidi di tengah
UNISDAUNISDA Dapat disimpulkan bahwa terdapat perbedaan yang signifikan antara kemampuan pemahaman konsep siswa yang diajar menggunakan Model Pembelajaran ARIFIN menggunakanDapat disimpulkan bahwa terdapat perbedaan yang signifikan antara kemampuan pemahaman konsep siswa yang diajar menggunakan Model Pembelajaran ARIFIN menggunakan