INABJINABJ

The Indonesian Biomedical JournalThe Indonesian Biomedical Journal

Latar belakang: Inositol hexakisphosphate (InsP₆) menunjukkan aktivitas antikanker, terutama dengan menginduksi jalur apoptosis intrinsik dan ekstrinsik. Namun, masih belum ada bukti docking molekuler yang secara langsung memeriksa interaksi InsP₆ dengan regulator apoptosis hulu atau hilir. Oleh karena itu, penelitian ini dilakukan untuk menyelidiki docking molekuler InsP₆ ke caspases sebagai regulator apoptosis hulu/hilir. Metode: Ligan termasuk InsP₆, InsP₅, InsP₄, inhibitor deasetilase histon, dan inhibitor caspase diambil dari PubChem, sementara protein target (histon, caspase-8, caspase-2, dan caspase-3) diperoleh dari Protein Data Bank. Toksisitas ligan diprediksi menggunakan ProTox-3.0, dan sifat fisikokimia dianalisis dengan SwissADME. Struktur ligan diminimkan energinya menggunakan PyRx dengan Universal Force Field, sementara protein disiapkan dengan menghilangkan molekul air dan heteroatom yang tidak penting di BIOVIA Discovery Studio. Docking molekuler dilakukan menggunakan CB-Dock 2.0, dengan pose ligan dipilih berdasarkan skor Vina terendah, dan interaksi ligan–protein divisualisasikan di Discovery Studio. Hasil: Hasil docking molekuler menunjukkan bahwa InsP₆ terikat kuat pada histon, caspase-8, caspase-2, dan caspase-3 dengan afinitas yang sebanding dengan inhibitor referensi, membentuk banyak ikatan hidrogen dengan residu sisi aktif utama. InsP₆, InsP₅, dan InsP₄ menunjukkan beberapa situs pengikatan serupa ke caspase-3, dengan hanya perbedaan kecil dalam afinitas pengikatan. Kesimpulan: InsP₆ menunjukkan ikatan kuat ke histon, caspase-8, caspase-2, dan caspase-3 berdasarkan hasil in silico, mendukung perannya dalam menginduksi jalur apoptosis ekstrinsik dan intrinsik. Secara keseluruhan, InsP₆ dapat menjadi induktor apoptosis potensial pada sel kanker.

InsP₆ menunjukkan ikatan kuat ke histon, caspase-8, caspase-2, dan caspase-3 berdasarkan hasil in silico, mendukung perannya dalam menginduksi jalur apoptosis ekstrinsik dan intrinsik.Secara keseluruhan, InsP₆ dapat menjadi induktor apoptosis potensial pada sel kanker.

Berdasarkan hasil penelitian ini, beberapa saran penelitian lanjutan dapat diajukan. Pertama, perlu dilakukan validasi in vitro terhadap hasil docking molekuler, dengan menguji interaksi langsung antara InsP₆ dan caspases menggunakan teknik biokimia dan biologi molekuler. Kedua, penelitian lebih lanjut dapat difokuskan pada identifikasi mekanisme spesifik bagaimana InsP₆ mengaktifkan caspases, termasuk peran intermediasi histon dalam proses tersebut. Ketiga, eksplorasi potensi kombinasi InsP₆ dengan agen antikanker lain, seperti inhibitor histon deasetilase, dapat menjadi arah penelitian yang menjanjikan untuk meningkatkan efikasi terapi kanker.

  1. Apoptosis: A Target for Anticancer Therapy. apoptosis target anticancer therapy next article journal... doi.org/10.3390/ijms19020448Apoptosis A Target for Anticancer Therapy apoptosis target anticancer therapy next article journal doi 10 3390 ijms19020448
  2. Structural and dynamic changes in P-Rex1 upon activation by PIP3 and inhibition by IP4 | eLife. structural... doi.org/10.7554/eLife.92822Structural and dynamic changes in P Rex1 upon activation by PIP3 and inhibition by IP4 eLife structural doi 10 7554 eLife 92822
  3. Inositol Hexaphosphate Inhibits Proliferation and Induces Apoptosis of Colon Cancer Cells by Suppressing... doi.org/10.3390/molecules22101657Inositol Hexaphosphate Inhibits Proliferation and Induces Apoptosis of Colon Cancer Cells by Suppressing doi 10 3390 molecules22101657
Read online
File size3.1 MB
Pages9
DMCAReport

Related /

ads-block-test